49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0809 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0809  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  197  3e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0768002  normal  0.858288 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1661  hypothetical protein  59.41 
 
 		 102 aa  113  7.999999999999999e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371749  hitchhiker  0.0000841753 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11900  hypothetical protein  67.33 
 
 		 102 aa  110  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000932793  normal  0.0171922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1864  integration host factor  55.88 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07810  hypothetical protein  60.4 
 
 		 102 aa  98.6  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.175394  normal  0.797766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1853  hypothetical protein  51.52 
 
 		 105 aa  97.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1860  hypothetical protein  51.52 
 
 		 105 aa  97.8  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.39326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3448  hypothetical protein  53 
 
 		 102 aa  97.1  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1712  integration host factor-like protein  59 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2812  hypothetical protein  58.16 
 
 		 107 aa  90.9  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3196  putative integration host factor MihF  57 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.242589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3098  hypothetical protein  52.04 
 
 		 101 aa  89.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1319  hypothetical protein  48 
 
 		 109 aa  88.6  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129436  normal  0.2348 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1359  hypothetical protein  57.58 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19805  normal  0.0604733 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1696  hypothetical protein  53.61 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.877224  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2435  hypothetical protein  46.81 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3008  hypothetical protein  59.18 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000974881  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4163  hypothetical protein  62 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1563  normal  0.37873 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1061  hypothetical protein  57.14 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3741  MihF  60.78 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2344  hypothetical protein  61.17 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2410  MihF  60.78 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2369  MIHF  60.78 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0348363  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2666  MihF  60.78 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2416  MihF  60.78 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.623884  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2579  putative integration host factor  58.25 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130539  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1849  hypothetical protein  56 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.317329  normal  0.137078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5239  hypothetical protein  58.59 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3156  hypothetical protein  57.58 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  hitchhiker  0.0000150374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5346  hypothetical protein  55.32 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2260  putative integration host factor IHF  50 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.46856  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11417  integration host factor mihF  57.84 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282847  normal  0.291955 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3128  hypothetical protein  60.2 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.168775  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1714  hypothetical protein  51.32 
 
 		 80 aa  73.9  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0927785  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14790  hypothetical protein  47.22 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.469927  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15610  hypothetical protein  57.58 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.167288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1294  putative integration host factor MihF  53.54 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.203046  normal  0.0715568 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2993  hypothetical protein  54 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.65036 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18020  hypothetical protein  51 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00327498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2041  hypothetical protein  52 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.537681  hitchhiker  0.00591086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33240  hypothetical protein  49.02 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12710  hypothetical protein  45.54 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0463914  normal  0.0241518 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1997  putative integration host factor IHF  57.14 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000128008 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0876  hypothetical protein  42.71 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3207  hypothetical protein  35.16 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426307  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4411  hypothetical protein  36.84 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0253049 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1474  hypothetical protein  34.34 
 
 		 108 aa  50.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0390254  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1634  hypothetical protein  34.94 
 
 		 124 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12560  hypothetical protein  37.8 
 
 		 104 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.588168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>