More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0610 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_07080  glutamate dehydrogenase  72.4 
 
 		 443 aa  685    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.813 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0610  glutamate dehydrogenase  100 
 
 		 443 aa  918    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0929396 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1801  glutamate dehydrogenase  70.36 
 
 		 443 aa  665    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.250235  normal  0.676275 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0826  glutamate dehydrogenase  67.12 
 
 		 444 aa  632  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0743965  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10490  glutamate dehydrogenase  68.22 
 
 		 451 aa  633  1e-180  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000302045 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1427  glutamate dehydrogenase  67.65 
 
 		 448 aa  620  1e-176  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1770  glutamate dehydrogenase  64.03 
 
 		 448 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1499  glutamate dehydrogenase  63.43 
 
 		 448 aa  598  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.981406  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1556  glutamate dehydrogenase  62.25 
 
 		 445 aa  587  1e-167  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.240563  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0467  glutamate dehydrogenase  64.41 
 
 		 450 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000753679  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2051  glutamate dehydrogenase  62.42 
 
 		 451 aa  580  1e-164  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.553496 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1335  glutamate dehydrogenase  63.29 
 
 		 449 aa  571  1.0000000000000001e-162  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.26176  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1339  glutamate dehydrogenase  63.1 
 
 		 449 aa  572  1.0000000000000001e-162  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.852226  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0374  glutamate dehydrogenase  63.96 
 
 		 444 aa  569  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000129016  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0818  glutamate dehydrogenase  60.72 
 
 		 447 aa  563  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274961 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2430  glutamate dehydrogenase  63.66 
 
 		 445 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0271  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  61.49 
 
 		 445 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0942  glutamate dehydrogenase  60 
 
 		 466 aa  558  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1152  glutamate dehydrogenase  60.58 
 
 		 449 aa  559  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3443  glutamate dehydrogenase  59.24 
 
 		 450 aa  556  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60710  glutamate dehydrogenase  61.19 
 
 		 445 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02515  glutamate dehydrogenase  61.95 
 
 		 447 aa  555  1e-157  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4852  glutamate dehydrogenase  61.54 
 
 		 444 aa  550  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2359  glutamate dehydrogenase  62.01 
 
 		 444 aa  549  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5228  glutamate dehydrogenase  60.96 
 
 		 445 aa  549  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4874  glutamate dehydrogenase  61.64 
 
 		 445 aa  545  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.443754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1771  glutamate dehydrogenase  60.27 
 
 		 445 aa  545  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89155  normal  0.439156 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000352  NADP-specific glutamate dehydrogenase  59.69 
 
 		 450 aa  541  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0675  glutamate dehydrogenase  60.73 
 
 		 449 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0706  glutamate dehydrogenase  60.73 
 
 		 446 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1895  glutamate dehydrogenase  59.24 
 
 		 450 aa  542  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0707  glutamate dehydrogenase  60.73 
 
 		 446 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.469869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4646  glutamate dehydrogenase  59.04 
 
 		 448 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1813  glutamate dehydrogenase  58.33 
 
 		 454 aa  541  9.999999999999999e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4509  glutamate dehydrogenase  60.73 
 
 		 446 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4267  glutamate dehydrogenase  59.04 
 
 		 448 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4353  glutamate dehydrogenase  59.04 
 
 		 448 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  0.0129009 
 
 
-
 
NC_002950  PG1232  glutamate dehydrogenase  58.17 
 
 		 445 aa  537  1e-151  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0886  glutamate dehydrogenase  59.06 
 
 		 452 aa  536  1e-151  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1371  glutamate dehydrogenase  59.95 
 
 		 452 aa  536  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.209216  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1510  glutamate dehydrogenase  59.47 
 
 		 450 aa  535  1e-151  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.299473  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32600  glutamate dehydrogenase  60.18 
 
 		 447 aa  535  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1647  glutamate dehydrogenase  58.89 
 
 		 451 aa  536  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2214  glutamate dehydrogenase  61.56 
 
 		 438 aa  537  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.171409  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1290  glutamate dehydrogenase  56.6 
 
 		 455 aa  532  1e-150  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0109  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  61.11 
 
 		 453 aa  532  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5140  glutamate dehydrogenase  59.51 
 
 		 447 aa  533  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0286  glutamate dehydrogenase  57.24 
 
 		 450 aa  532  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000707094  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1459  glutamate dehydrogenase  59.06 
 
 		 447 aa  533  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0346  glutamate dehydrogenase  59.23 
 
 		 445 aa  529  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16151  glutamate dehydrogenase  60 
 
 		 451 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.241979 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0418  glutamate dehydrogenase  58.9 
 
 		 449 aa  529  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1815  glutamate dehydrogenase  57.72 
 
 		 452 aa  525  1e-148  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2296  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  61.16 
 
 		 445 aa  527  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34200  glutamate dehydrogenase (NADP)  59.82 
 
 		 446 aa  526  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1144  glutamate dehydrogenase  58.92 
 
 		 448 aa  526  1e-148  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000210834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0892  glutamate dehydrogenase  58.54 
 
 		 447 aa  523  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4692  glutamate dehydrogenase  58.2 
 
 		 444 aa  523  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4200  glutamate dehydrogenase  59.63 
 
 		 447 aa  523  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0977  glutamate dehydrogenase  58.54 
 
 		 447 aa  523  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0965022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2047  glutamate dehydrogenase  59.27 
 
 		 447 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4036  glutamate dehydrogenase  58.22 
 
 		 447 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1426  glutamate dehydrogenase  59.27 
 
 		 447 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.91122 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4483  glutamate dehydrogenase  59.4 
 
 		 447 aa  521  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1393  glutamate dehydrogenase  59.27 
 
 		 447 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221099  normal  0.113397 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0527  glutamate dehydrogenase  57.53 
 
 		 450 aa  518  1e-146  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000275062  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1410  glutamate dehydrogenase  59.27 
 
 		 447 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4804  glutamate dehydrogenase  58.45 
 
 		 449 aa  519  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1876  glutamate dehydrogenase  59.27 
 
 		 447 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0272489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4089  glutamate dehydrogenase  58.22 
 
 		 447 aa  518  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1457  glutamate dehydrogenase  57.48 
 
 		 448 aa  518  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0573  glutamate dehydrogenase  58.93 
 
 		 448 aa  518  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0119  glutamate dehydrogenase  58.22 
 
 		 447 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2911  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  58.9 
 
 		 445 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2800  glutamate dehydrogenase  58.58 
 
 		 449 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00630068  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0708  glutamate dehydrogenase  57.92 
 
 		 447 aa  518  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4441  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  59.3 
 
 		 449 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.542579  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1286  glutamate dehydrogenase  57.94 
 
 		 447 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000501948  hitchhiker  0.000436028 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2125  glutamate dehydrogenase  59.63 
 
 		 447 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0411981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1685  glutamate dehydrogenase  58.41 
 
 		 447 aa  515  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3577  glutamate dehydrogenase  59.53 
 
 		 445 aa  512  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1212  glutamate dehydrogenase  59.86 
 
 		 446 aa  512  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2481  glutamate dehydrogenase  57.76 
 
 		 447 aa  511  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.231621  normal  0.944687 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3724  glutamate dehydrogenase  57.53 
 
 		 447 aa  512  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1929  glutamate dehydrogenase  58.85 
 
 		 449 aa  514  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2014  glutamate dehydrogenase  57.76 
 
 		 447 aa  512  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4667  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  60.18 
 
 		 449 aa  511  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0396  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  58.77 
 
 		 447 aa  514  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1272  glutamate dehydrogenase  60.36 
 
 		 451 aa  512  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0527  glutamate dehydrogenase  58.8 
 
 		 447 aa  512  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000736482  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3505  glutamate dehydrogenase  59.53 
 
 		 445 aa  514  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1658  glutamate dehydrogenase  58.14 
 
 		 458 aa  513  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1881  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  57.53 
 
 		 447 aa  511  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.53168  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1670  glutamate dehydrogenase  56.85 
 
 		 448 aa  511  1e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.881879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1871  glutamate dehydrogenase  57.53 
 
 		 447 aa  511  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.598381  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3019  glutamate dehydrogenase  57.05 
 
 		 449 aa  508  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1845  glutamate dehydrogenase  57.53 
 
 		 447 aa  511  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0654574  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3219  glutamate dehydrogenase  57.05 
 
 		 449 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1429  glutamate dehydrogenase  57.53 
 
 		 447 aa  510  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00746713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30790  glutamate dehydrogenase  59.31 
 
 		 447 aa  510  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>