260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0286 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0286  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 		 679 aa  1419    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0769555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0664  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  27.7 
 
 		 383 aa  185  3e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.637841 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1435  hypothetical protein  22.1 
 
 		 386 aa  87  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0402  inner membrane protein, 60 kDa  27.78 
 
 		 566 aa  72  0.00000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  22.83 
 
 		 517 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.57 
 
 		 531 aa  68.6  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.56 
 
 		 518 aa  67.8  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.61 
 
 		 526 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.22 
 
 		 532 aa  65.9  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0293  putative inner membrane protein translocase component YidC  22.79 
 
 		 579 aa  65.9  0.000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1626  hypothetical protein  22.33 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  25.4 
 
 		 545 aa  63.9  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  24.61 
 
 		 344 aa  63.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000325406  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  25.43 
 
 		 341 aa  63.9  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.14 
 
 		 575 aa  63.5  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  25.76 
 
 		 278 aa  63.9  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  22.97 
 
 		 553 aa  63.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0522  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.85 
 
 		 787 aa  62.8  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  25 
 
 		 595 aa  63.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0782  putative inner membrane protein translocase component YidC  22.73 
 
 		 579 aa  62.4  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  24.04 
 
 		 557 aa  62.4  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  25 
 
 		 547 aa  62.4  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0119  60 kDa inner membrane insertion protein  24.76 
 
 		 209 aa  62  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0881  60 kDa inner membrane insertion protein  21.89 
 
 		 514 aa  61.6  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  24.77 
 
 		 539 aa  61.2  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  27.11 
 
 		 609 aa  61.2  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  27.57 
 
 		 552 aa  60.8  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  22.87 
 
 		 530 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2932  60 kDa inner membrane insertion protein  28.08 
 
 		 213 aa  59.3  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000772095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  22.87 
 
 		 530 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.17 
 
 		 609 aa  58.5  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1263  60 kDa inner membrane insertion protein  21.66 
 
 		 531 aa  58.2  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00209254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  23.98 
 
 		 536 aa  58.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  24.52 
 
 		 543 aa  58.2  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.4 
 
 		 620 aa  58.2  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.15 
 
 		 553 aa  58.2  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  22.86 
 
 		 528 aa  57.8  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  22.37 
 
 		 532 aa  57.8  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3703  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.36 
 
 		 609 aa  57.4  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.24 
 
 		 554 aa  57  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  22.52 
 
 		 330 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  24.38 
 
 		 542 aa  57  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2994  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.99 
 
 		 238 aa  57  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0429051  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.24 
 
 		 554 aa  57  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  21.86 
 
 		 219 aa  56.6  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1921  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.45 
 
 		 616 aa  56.2  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.010841  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  27.94 
 
 		 556 aa  56.2  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  27.94 
 
 		 556 aa  56.2  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  22.63 
 
 		 308 aa  56.2  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  20.85 
 
 		 544 aa  56.6  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3121  60 kDa inner membrane insertion protein  22.52 
 
 		 261 aa  55.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000331776  hitchhiker  0.0000000745371 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  24.48 
 
 		 562 aa  56.6  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  23.56 
 
 		 345 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  24.71 
 
 		 617 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0640  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.85 
 
 		 630 aa  55.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.138762  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1736  60 kDa inner membrane insertion protein  24.19 
 
 		 245 aa  55.5  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3610  OxaA-like protein precursor  24.34 
 
 		 257 aa  55.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  25.52 
 
 		 300 aa  55.1  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  22.46 
 
 		 544 aa  54.7  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2671  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.86 
 
 		 238 aa  55.1  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.372035  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  25.13 
 
 		 229 aa  55.1  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  23.47 
 
 		 604 aa  55.1  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  22.56 
 
 		 536 aa  54.7  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  24.47 
 
 		 551 aa  54.7  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6484  60 kDa inner membrane insertion protein  28.87 
 
 		 366 aa  54.3  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0489623  normal  0.0985763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  23.96 
 
 		 605 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  22.79 
 
 		 555 aa  54.3  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  25.12 
 
 		 624 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.74 
 
 		 552 aa  54.3  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.29 
 
 		 610 aa  53.9  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.29 
 
 		 610 aa  53.9  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.74 
 
 		 552 aa  53.9  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2224  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.87 
 
 		 565 aa  53.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.176857  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2314  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.87 
 
 		 565 aa  53.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.87 
 
 		 550 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  29.52 
 
 		 350 aa  53.5  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4590  60 kDa inner membrane insertion protein  27.1 
 
 		 370 aa  53.5  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  hitchhiker  0.000511998 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  25.48 
 
 		 592 aa  53.5  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  22.96 
 
 		 597 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  22.11 
 
 		 545 aa  53.5  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2396  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.79 
 
 		 582 aa  52.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.67 
 
 		 597 aa  53.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.74 
 
 		 558 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.74 
 
 		 558 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.74 
 
 		 558 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.08 
 
 		 555 aa  52.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0976  60 kDa inner membrane insertion protein  23.23 
 
 		 515 aa  53.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000560326  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.74 
 
 		 558 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.74 
 
 		 558 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  23.96 
 
 		 225 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.74 
 
 		 557 aa  52.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.74 
 
 		 558 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.74 
 
 		 558 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1784  60 kDa inner membrane insertion protein  25.39 
 
 		 557 aa  52.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299868  normal  0.294876 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2035  60 kDa inner membrane insertion protein  29.29 
 
 		 336 aa  52.8  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.59 
 
 		 567 aa  52.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3943  60 kDa inner membrane insertion protein  26.27 
 
 		 442 aa  52.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  22.82 
 
 		 566 aa  52  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  24.69 
 
 		 614 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  22.8 
 
 		 548 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>