40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0168 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0168  protein of unknown function DUF1021  100 
 
 		 96 aa  194  3e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.114258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07490  hypothetical protein  59.55 
 
 		 112 aa  106  8.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.635673  normal  0.494829 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2656  hypothetical protein  61.73 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.214859 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04930  hypothetical protein  63.75 
 
 		 111 aa  98.2  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0048  protein of unknown function DUF1021  47.37 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0055  hypothetical protein  48.1 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000091606  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0057  hypothetical protein  49.15 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000870517 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0038  hypothetical protein  43.66 
 
 		 87 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0041  veg protein  43.66 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0052  veg protein  43.66 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0048  veg protein  43.66 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.503705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5268  veg protein  43.66 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.868803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0048  veg protein  43.66 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0041  veg protein  43.66 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0039  veg protein  43.66 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0039  veg protein  43.66 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0042  veg protein  43.66 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0170  protein of unknown function DUF1021  45.21 
 
 		 91 aa  62  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105171  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0038  hypothetical protein  41.1 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0037  protein of unknown function DUF1021  37.14 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21690  hypothetical protein  40 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.484922  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0132  hypothetical protein  48.28 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0039  protein of unknown function DUF1021  37.14 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0144278  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0597  hypothetical protein  40.51 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0403  protein of unknown function DUF1021  42.86 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0277649  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0528  hypothetical protein  44.83 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0456568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0515  hypothetical protein  44.83 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000247738  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0214  hypothetical protein  37.33 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.615311  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0020  protein of unknown function DUF1021  44.83 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2401  hypothetical protein  38.81 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.273851  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1548  hypothetical protein  41.79 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2190  hypothetical protein  38.57 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2480  hypothetical protein  38.57 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1612  hypothetical protein  34.72 
 
 		 81 aa  51.2  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2403  protein of unknown function DUF1021  31.4 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3814  hypothetical protein  37.29 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000228134  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0791  hypothetical protein  30.77 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00610853  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2138  hypothetical protein  29.47 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185054  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0209  hypothetical protein  34.43 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000139685  normal  0.0119119 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2442  hypothetical protein  37.14 
 
 		 80 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>