77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0081 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0081  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose- specific IIA subunit  100 
 
 		 111 aa  223  9e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3045  PTS system, lactose/cellobiose-specific IIA subunit  52.58 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2600  phosphotransferase system enzyme II, ptcA  38.95 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2902  PTS system protein  38.61 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2581  PTS system  37.62 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3752  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose-specific IIA subunit  35.29 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5298  PTS system, cellobiose-specific IIA component  34.31 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000267843 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4902  PTS system, cellobiose-specific IIA component (phosphotransferase enzyme II, A component)  34.31 
 
 		 107 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5057  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIA  34.31 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5442  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIA  34.31 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4887  PTS system, cellobiose-specific IIA component (phosphotransferase enzyme II, A component)  34.31 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5374  PTS system, cellobiose-specific IIA component  34.31 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5329  PTS system, cellobiose-specific IIA component  34.31 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5630  PTS system, cellobiose-specific IIA component  34.31 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000583884 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5002  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose-specific IIA subunit  33.33 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5319  PTS system, cellobiose-specific IIA component  34.31 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3457  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose- specific IIA subunit  34.41 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0791  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIA  32.04 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0752  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIA  32.04 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0700  PTS system, cellobiose-specific IIA component  32.04 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0884  PTS system, cellobiose-specific IIA component  32.04 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.986840000000001e-32 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0702  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose-specific IIA subunit  32 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5447  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIA  30.39 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4907  PTS system, cellobiose-specific IIA component (phosphotransferase enzyme II, A component)  30.39 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5303  PTS system, cellobiose-specific IIA component  30.39 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000834521 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0882  PTS system, cellobiose-specific IIA component  32 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5324  PTS system, cellobiose-specific IIA component  30.39 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5062  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIA  30.39 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4894  PTS system, cellobiose-specific IIA component (phosphotransferase enzyme II, A component)  30.39 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0953  PTS system, cellobiose-specific IIA component  32 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0687  PTS system, cellobiose-specific IIA component  32.04 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5625  PTS system, cellobiose-specific IIA component  30.39 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000471892 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4492  PTS system, cellobiose-specific IIA component  32.04 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000130879 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5005  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose-specific IIA subunit  29.41 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3755  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose-specific IIA subunit  30.53 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B05  chitibiose transporter protein chbA  32.26 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2030  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIA  31.63 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1857  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIA  31.63 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.753754  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1428  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIA  31.63 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.33758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1443  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIA  31.63 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1411  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIA  31.63 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.988093  normal  0.0554493 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1708  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIA  29.59 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2137  PTS system, lactose-specific IIa component  32.08 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0844  PTS system, cellobiose-specific IIA component  31 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1856  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose-specific IIA subunit  29.81 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0035  phosphotransferase system PTS, lactose/cellobiose-specific IIA subunit  26.73 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.552409 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01693  hypothetical protein  29.59 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1906  PTS system, lactose-specific IIa component  29.59 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00656424  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0339  cellobiose-specific PTS system IIA component  29.47 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01705  N,N'-diacetylchitobiose-specific enzyme IIA component of PTS  29.59 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1957  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIA  29.59 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1455  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIA  29.59 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.305267 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2454  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIA  29.59 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1896  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIA  29.59 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.398825  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2222  PTS system, lactose-specific IIA component  26.88 
 
 		 103 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2261  PTS system, lactose-specific IIA component  26.88 
 
 		 103 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5381  PTS system, cellobiose-specific IIA component  30.77 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1203  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose- specific IIA subunit  29.9 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2106  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose-specific IIA subunit  27.45 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.30662  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1822  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose-specific IIA subunit  25.74 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.382223  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1791  PTS system, lactose-specific IIA component  27.96 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D02  cellobiose-specific PTS system IIA component  26.88 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000740082  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0197  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose- specific IIA subunit  28.12 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0265  phosphotransferase system PTS, lactose/cellobiose-specific IIA subunit  29.17 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5334  PTS system, cellobiose-specific IIA component  30.77 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3347  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose- specific IIA subunit  28.42 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0930  cellobiose phosphotransferase system IIA component  27.55 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1207  cellobiose-specific PTS system IIA component  25.25 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0222  cellobiose-specific PTS system IIA component  25.25 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1616  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose- specific IIA subunit  28.12 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0466  cellobiose-specific PTS system IIA component  29.35 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00160406  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0735  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose-specific IIA subunit  28.16 
 
 		 108 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4590  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose-specific IIA subunit  28.57 
 
 		 114 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2669  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose-specific IIA subunit  24.73 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1093  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIA  25 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000414863  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1146  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIA  25 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.180764  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0500  cellobiose-specific PTS system IIA component  26.53 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0010814  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>