27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0065 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0065  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  548  1e-155  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  33.7 
 
 		 727 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  33.7 
 
 		 723 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  39.18 
 
 		 908 aa  56.6  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  33.04 
 
 		 723 aa  56.2  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  30.28 
 
 		 730 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  33.7 
 
 		 755 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  30.3 
 
 		 727 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  37.5 
 
 		 885 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  33.66 
 
 		 748 aa  48.9  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  29.35 
 
 		 743 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  35.09 
 
 		 879 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  29.55 
 
 		 730 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  30.3 
 
 		 741 aa  47  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  30.68 
 
 		 878 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  34.29 
 
 		 914 aa  46.6  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  32.89 
 
 		 751 aa  46.2  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26250  hypothetical protein  31.17 
 
 		 152 aa  45.8  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  41.51 
 
 		 871 aa  45.8  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  33.33 
 
 		 894 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  33.33 
 
 		 882 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  35.23 
 
 		 886 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  35.23 
 
 		 886 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  31.82 
 
 		 883 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  36.11 
 
 		 910 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03470  hypothetical protein  29.07 
 
 		 134 aa  43.1  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.241528 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  36.62 
 
 		 722 aa  43.1  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>