More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3792 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3792  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  100 
 
 
230 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0756437  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3876  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  100 
 
 
230 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0338517  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3735  sigma-24 (FecI-like)  90.52 
 
 
232 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.719023  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2177  RNA polymerase sigma factor RpoE  37.04 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.242833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2425  RNA polymerase sigma factor RpoE  38.17 
 
 
199 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0205284  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1471  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  41.28 
 
 
190 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133791  normal  0.688879 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2259  RNA polymerase sigma factor RpoE  37.63 
 
 
199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033618  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4239  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.51 
 
 
199 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535457  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1736  RNA polymerase sigma factor RpoE  38.17 
 
 
215 aa  112  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1085  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.51 
 
 
199 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0647  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.51 
 
 
199 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1127  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.51 
 
 
199 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3246  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.79 
 
 
208 aa  111  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0104683 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0834  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.51 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1723  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.51 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2786  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.51 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0536  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.51 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.543409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2901  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.51 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2321  RNA polymerase sigma factor RpoE  37.17 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2808  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.51 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0856  RNA polymerase sigma factor RpoE  34.39 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000380767  normal  0.0292756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1000  RNA polymerase sigma factor RpoE  34.39 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000231343  normal  0.0259336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1078  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.51 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478507  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2473  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.51 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1796  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.51 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.7113  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2906  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.51 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419523  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1007  RNA polymerase sigma factor RpoE  35.98 
 
 
199 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35525  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1003  RNA polymerase sigma factor RpoE  35.98 
 
 
199 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2848  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.51 
 
 
392 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0920  RNA polymerase sigma factor RpoE  37.1 
 
 
199 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.776822  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0985  RNA polymerase sigma factor RpoE  37.1 
 
 
199 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664585  normal  0.0675077 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1083  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.51 
 
 
191 aa  108  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1395  RNA polymerase sigma factor RpoE  35.79 
 
 
224 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3643  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.65 
 
 
211 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.145973  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3068  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.13 
 
 
211 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1532  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  40.59 
 
 
180 aa  106  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0195109  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1055  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.02 
 
 
199 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.401808  normal  0.607053 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03542  RNA polymerase sigma factor RpoE  32.62 
 
 
192 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1471  RNA polymerase sigma factor RpoE  33.33 
 
 
192 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0040  RNA polymerase sigma factor RpoE  36.41 
 
 
194 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1189  RNA polymerase sigma factor RpoE  33.97 
 
 
209 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209698  normal  0.0286964 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2731  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.4 
 
 
184 aa  102  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1746  RNA polymerase sigma factor RpoE  34.41 
 
 
200 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.30228  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002491  RNA polymerase sigma factor RpoE  32.62 
 
 
192 aa  102  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.012541  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2095  RNA polymerase sigma factor RpoE  35.33 
 
 
198 aa  102  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1339  RNA polymerase sigma factor RpoE  35.83 
 
 
191 aa  101  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0150  RNA polymerase sigma factor SigW  34.83 
 
 
190 aa  101  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2045  RNA polymerase sigma factor RpoE  33.16 
 
 
190 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2251  RNA polymerase sigma factor AlgU  33.51 
 
 
193 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015974  normal  0.140687 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1467  RNA polymerase sigma factor AlgU  33.86 
 
 
193 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000401501  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1133  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.26 
 
 
195 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2068  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  37.71 
 
 
192 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.903797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2981  RNA polymerase sigma factor RpoE  33.85 
 
 
206 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000395274  normal  0.05783 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2267  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  39.78 
 
 
196 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0916495  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3155  RNA polymerase sigma factor RpoE  34.22 
 
 
192 aa  99.4  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000329481  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0701  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  36.36 
 
 
208 aa  99.4  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.212033  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3616  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.88 
 
 
200 aa  99  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154069  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5267  RNA polymerase sigma factor RpoE  33.96 
 
 
223 aa  99  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1771  RNA polymerase sigma factor RpoE  33.88 
 
 
197 aa  98.6  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000506111  hitchhiker  0.000648476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3433  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  37.42 
 
 
185 aa  97.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1239  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.38 
 
 
192 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00674389  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1237  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.91 
 
 
192 aa  97.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000109114  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4757  RNA polymerase sigma factor AlgU  33.86 
 
 
193 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1272  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.38 
 
 
192 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178396  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1195  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.38 
 
 
192 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2178  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  39.78 
 
 
196 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.103382  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1956  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.98 
 
 
193 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1438  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.53 
 
 
206 aa  97.8  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.389052  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54430  RNA polymerase sigma factor AlgU  33.86 
 
 
193 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000031272  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2934  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.16 
 
 
180 aa  97.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690007  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3118  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.38 
 
 
192 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.239779  normal  0.0316292 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1369  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.53 
 
 
206 aa  97.8  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0484883  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1115  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.91 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.37407  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3958  RNA polymerase sigma factor AlgU  32.8 
 
 
193 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0486119  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1678  sigma-24 (FecI-like)  38.67 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3274  RNA polymerase sigma factor RpoE  34.31 
 
 
211 aa  97.4  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0690912  normal  0.387372 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3187  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.76 
 
 
200 aa  97.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0312752  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2531  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.02 
 
 
192 aa  97.1  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1394  RNA polymerase sigma-E factor  35.91 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0732931  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2252  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  31.05 
 
 
193 aa  96.7  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708239  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2627  RNA polymerase sigma factor RpoE  34.31 
 
 
211 aa  95.9  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4224  RNA polymerase sigma-24 factor  32.8 
 
 
193 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2936  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.38 
 
 
192 aa  95.5  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0097263  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1427  RNA polymerase sigma factor AlgU  32.28 
 
 
193 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0770858  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1067  RNA polymerase sigma factor AlgU  32.28 
 
 
193 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0360661  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1153  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.85 
 
 
192 aa  95.1  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000609864  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4380  RNA polymerase sigma factor AlgU  32.28 
 
 
193 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.200849 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2772  RNA polymerase sigma factor AlgU  31.38 
 
 
192 aa  95.1  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.133926  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4294  RNA polymerase sigma factor AlgU  32.28 
 
 
193 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.55493  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2854  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.38 
 
 
192 aa  95.1  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0729603  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3032  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.38 
 
 
192 aa  95.1  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0207774  normal  0.587259 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0154  RNA polymerase sigma factor SigW  31.46 
 
 
183 aa  94.7  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000564665  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1342  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.85 
 
 
192 aa  94.7  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1031  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.85 
 
 
192 aa  94.7  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000464646  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2022  RNA polymerase sigma factor RpoE  32.98 
 
 
199 aa  94.4  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000162889  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1362  RNA polymerase sigma factor AlgU  32.28 
 
 
193 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00625661  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1142  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.85 
 
 
192 aa  94.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000720782  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2663  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.99 
 
 
189 aa  94.4  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0800237  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02431  hypothetical protein  33.69 
 
 
191 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2859  RNA polymerase sigma factor RpoE  33.69 
 
 
191 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0265071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>