56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_R0056 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_R0056  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0428087  normal  0.775874 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0057  tRNA-Ser  94.57 
 
 
92 bp  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0058  tRNA-Ser  94.57 
 
 
92 bp  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0058  tRNA-Ser  94.57 
 
 
92 bp  127  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0026  tRNA-Ser  86.67 
 
 
91 bp  61.9  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.548362  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0033  tRNA-Ser  91.49 
 
 
90 bp  61.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0657  tRNA-Ser  85.14 
 
 
93 bp  56  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.96086  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0040  tRNA-Ser  94.29 
 
 
90 bp  54  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.140248 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0911  tRNA-Ser  94.29 
 
 
90 bp  54  0.000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.531015  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1009  tRNA-Ser  94.29 
 
 
92 bp  54  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2302  tRNA-Ser  94.29 
 
 
92 bp  54  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000177345  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0025  tRNA-Ser  94.29 
 
 
90 bp  54  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0004  tRNA-Ser  94.29 
 
 
90 bp  54  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.888303  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0027  tRNA-Ser  94.29 
 
 
90 bp  54  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.5818  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt11  tRNA-Ser  94.29 
 
 
90 bp  54  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644598  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0033  tRNA-Ser  94.29 
 
 
90 bp  54  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56325  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60240  tRNA-Ser  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268246  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0100  tRNA-Ser  94.29 
 
 
96 bp  54  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.170842  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0067  tRNA-Ser  94.29 
 
 
90 bp  54  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27190  tRNA-Ser  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000521392  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0833  tRNA-Ser  92.11 
 
 
90 bp  52  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6042  tRNA-Ser  90.48 
 
 
90 bp  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516287  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0025  tRNA-Ser  90.48 
 
 
90 bp  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217878  normal  0.142788 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0042  tRNA-Ser  91.89 
 
 
93 bp  50.1  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.810595  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0017  tRNA-Ser  91.67 
 
 
90 bp  48.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576804  normal  0.691356 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60450  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  48.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.287736  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0018  tRNA-Ser  91.67 
 
 
94 bp  48.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0346344 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0030  tRNA-Ser  91.67 
 
 
94 bp  48.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0057  tRNA-Ser  91.43 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0001  tRNA-Ser  91.43 
 
 
91 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0042  tRNA-Ser  87.23 
 
 
93 bp  46.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00852582  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0016  tRNA-Ser  91.43 
 
 
91 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0021  tRNA-Ser  91.43 
 
 
91 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0717904 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0016  tRNA-Ser  89.47 
 
 
93 bp  44.1  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0008  tRNA-Ser  91.18 
 
 
90 bp  44.1  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0008  tRNA-Ser  91.18 
 
 
93 bp  44.1  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0005  tRNA-Ser  89.47 
 
 
95 bp  44.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0047  tRNA-Ser  91.18 
 
 
91 bp  44.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.018693  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0029  tRNA-Ser  91.18 
 
 
91 bp  44.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.287395  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0060  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  44.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.472015 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0059  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  44.1  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  88.1 
 
 
91 bp  44.1  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0036  tRNA-Ser  89.47 
 
 
90 bp  44.1  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.325342  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0036  tRNA-Ser  89.47 
 
 
93 bp  44.1  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0006  tRNA-Ser  91.18 
 
 
93 bp  44.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0009  tRNA-Ser  93.33 
 
 
86 bp  44.1  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0014  tRNA-Ser  91.18 
 
 
90 bp  44.1  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359735  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0025  tRNA-Ser  91.18 
 
 
91 bp  44.1  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000078606  normal  0.16194 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0006  tRNA-Ser  91.18 
 
 
93 bp  44.1  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0051  tRNA-Ser  81.4 
 
 
90 bp  44.1  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000000406758  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0046  tRNA-Ser  91.18 
 
 
92 bp  44.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.574265  normal  0.350655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0038  tRNA-Ser  89.47 
 
 
93 bp  44.1  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125413  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0066  tRNA-Ser  91.18 
 
 
91 bp  44.1  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00163913  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0010  tRNA-Ser  82.43 
 
 
90 bp  44.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999563  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0038  tRNA-Ser  81.4 
 
 
90 bp  44.1  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0031  tRNA-Ser  89.47 
 
 
93 bp  44.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.981637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>