232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0144 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0144  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
221 aa  434  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0402139  normal  0.55129 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0158  transcriptional regulator, TetR family  76.12 
 
 
207 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0140  TetR family transcriptional regulator  76.12 
 
 
208 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0147  transcriptional regulator, TetR family  76.12 
 
 
207 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 
231 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 
231 aa  62  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
226 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4062  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
218 aa  60.1  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  30.34 
 
 
239 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  25.62 
 
 
240 aa  58.9  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 
220 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
210 aa  56.6  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 
251 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
210 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
210 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
210 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
233 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
259 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
259 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
259 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 
248 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
211 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
210 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 
214 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 
225 aa  52.4  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 
204 aa  52.4  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 
225 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 
246 aa  52  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
201 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
201 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2348  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
192 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.105911 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2244  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
192 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  33.33 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
215 aa  50.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  51.11 
 
 
196 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  23.43 
 
 
204 aa  50.1  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  41.49 
 
 
209 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
196 aa  48.9  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1062  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
210 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0959794  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4234  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 
192 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0811126  normal  0.324857 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 
254 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
210 aa  48.9  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6717  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 
195 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.477187  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4577  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 
196 aa  48.5  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.957651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 
220 aa  48.5  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 
225 aa  48.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 
263 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 
243 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0232  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 
242 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  25.12 
 
 
214 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  21.2 
 
 
202 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  35.11 
 
 
246 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 
227 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 
221 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 
190 aa  47  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1888  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  23.59 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 
186 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  22.68 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
224 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
224 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
210 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
232 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
232 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
232 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2860  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
226 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.253372  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
232 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
232 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>