More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2051 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02515  glutamate dehydrogenase  66.74 
 
 		 447 aa  634    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0942  glutamate dehydrogenase  70.11 
 
 		 466 aa  671    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0818  glutamate dehydrogenase  74.27 
 
 		 447 aa  702    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274961 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2051  glutamate dehydrogenase  100 
 
 		 451 aa  941    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.553496 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1556  glutamate dehydrogenase  73.44 
 
 		 445 aa  694    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.240563  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1771  glutamate dehydrogenase  65.16 
 
 		 445 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89155  normal  0.439156 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60710  glutamate dehydrogenase  65.16 
 
 		 445 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3443  glutamate dehydrogenase  64.38 
 
 		 450 aa  601  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1212  glutamate dehydrogenase  66.52 
 
 		 446 aa  600  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2214  glutamate dehydrogenase  65.83 
 
 		 438 aa  600  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.171409  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07080  glutamate dehydrogenase  64.51 
 
 		 443 aa  595  1e-169  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5228  glutamate dehydrogenase  64.03 
 
 		 445 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0675  glutamate dehydrogenase  64.48 
 
 		 449 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0706  glutamate dehydrogenase  64.48 
 
 		 446 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1339  glutamate dehydrogenase  63.72 
 
 		 449 aa  589  1e-167  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.852226  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4509  glutamate dehydrogenase  64.48 
 
 		 446 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0707  glutamate dehydrogenase  64.25 
 
 		 446 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.469869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1427  glutamate dehydrogenase  63.36 
 
 		 448 aa  586  1e-166  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4874  glutamate dehydrogenase  62.92 
 
 		 445 aa  585  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.443754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1801  glutamate dehydrogenase  62.95 
 
 		 443 aa  583  1.0000000000000001e-165  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.250235  normal  0.676275 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0610  glutamate dehydrogenase  62.42 
 
 		 443 aa  580  1e-164  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0929396 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1647  glutamate dehydrogenase  62.31 
 
 		 451 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1770  glutamate dehydrogenase  62.31 
 
 		 448 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10490  glutamate dehydrogenase  61.59 
 
 		 451 aa  570  1e-161  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000302045 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0527  glutamate dehydrogenase  60.89 
 
 		 450 aa  569  1e-161  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000275062  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0467  glutamate dehydrogenase  62.83 
 
 		 450 aa  571  1e-161  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000753679  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0708  glutamate dehydrogenase  61.76 
 
 		 447 aa  568  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1272  glutamate dehydrogenase  63.35 
 
 		 451 aa  566  1e-160  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1499  glutamate dehydrogenase  61.86 
 
 		 448 aa  566  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.981406  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4483  glutamate dehydrogenase  61.28 
 
 		 447 aa  567  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16151  glutamate dehydrogenase  62.27 
 
 		 451 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.241979 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0374  glutamate dehydrogenase  64.41 
 
 		 444 aa  566  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000129016  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1426  glutamate dehydrogenase  60.62 
 
 		 447 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.91122 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2047  glutamate dehydrogenase  60.62 
 
 		 447 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1410  glutamate dehydrogenase  60.4 
 
 		 447 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1876  glutamate dehydrogenase  60.62 
 
 		 447 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0272489  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0826  glutamate dehydrogenase  60.85 
 
 		 444 aa  561  1.0000000000000001e-159  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0743965  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4200  glutamate dehydrogenase  60.62 
 
 		 447 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1393  glutamate dehydrogenase  60.62 
 
 		 447 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221099  normal  0.113397 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1459  glutamate dehydrogenase  60.09 
 
 		 447 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0452  glutamate dehydrogenase  59.78 
 
 		 447 aa  558  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2014  glutamate dehydrogenase  60.4 
 
 		 447 aa  558  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2481  glutamate dehydrogenase  60.4 
 
 		 447 aa  558  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.231621  normal  0.944687 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1429  glutamate dehydrogenase  60.4 
 
 		 447 aa  558  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00746713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5140  glutamate dehydrogenase  59.91 
 
 		 447 aa  560  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1813  glutamate dehydrogenase  60.09 
 
 		 454 aa  559  1e-158  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01730  glutamate dehydrogenase  59.96 
 
 		 447 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00719623  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1881  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  59.96 
 
 		 447 aa  556  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.53168  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1845  glutamate dehydrogenase  59.96 
 
 		 447 aa  556  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0654574  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01718  hypothetical protein  59.96 
 
 		 447 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00971306  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3724  glutamate dehydrogenase  60.65 
 
 		 447 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0527  glutamate dehydrogenase  59.86 
 
 		 447 aa  557  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000736482  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1984  glutamate dehydrogenase  60.4 
 
 		 447 aa  558  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000158842  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4852  glutamate dehydrogenase  63.03 
 
 		 444 aa  556  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1871  glutamate dehydrogenase  59.96 
 
 		 447 aa  556  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.598381  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_002950  PG1232  glutamate dehydrogenase  59.19 
 
 		 445 aa  554  1e-156  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4692  glutamate dehydrogenase  60.18 
 
 		 444 aa  554  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1510  glutamate dehydrogenase  61.01 
 
 		 450 aa  551  1e-156  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.299473  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0109  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  62.27 
 
 		 453 aa  552  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1685  glutamate dehydrogenase  59.07 
 
 		 447 aa  551  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1290  glutamate dehydrogenase  59.04 
 
 		 455 aa  551  1e-156  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1152  glutamate dehydrogenase  61.64 
 
 		 449 aa  549  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1335  glutamate dehydrogenase  61.42 
 
 		 449 aa  548  1e-155  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.26176  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1186  glutamate dehydrogenase  62.9 
 
 		 450 aa  548  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0573  glutamate dehydrogenase  61.88 
 
 		 448 aa  549  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5114  glutamate dehydrogenase  57.78 
 
 		 462 aa  548  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0629233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1330  glutamate dehydrogenase  61.82 
 
 		 453 aa  548  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.40508 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3497  glutamate dehydrogenase  62.44 
 
 		 451 aa  548  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2430  glutamate dehydrogenase  62.7 
 
 		 445 aa  551  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0271  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  61.47 
 
 		 445 aa  548  1e-154  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1457  glutamate dehydrogenase  58.14 
 
 		 448 aa  546  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3019  glutamate dehydrogenase  62.05 
 
 		 449 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0892  glutamate dehydrogenase  59.5 
 
 		 447 aa  545  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2771  glutamate dehydrogenase  60.63 
 
 		 451 aa  546  1e-154  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0977  glutamate dehydrogenase  59.5 
 
 		 447 aa  545  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0965022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3219  glutamate dehydrogenase  61.59 
 
 		 449 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3118  glutamate dehydrogenase  61.82 
 
 		 449 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2447  glutamate dehydrogenase  59.26 
 
 		 447 aa  543  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0286  glutamate dehydrogenase  58.9 
 
 		 450 aa  543  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000707094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2800  glutamate dehydrogenase  61.71 
 
 		 449 aa  544  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00630068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1305  glutamate dehydrogenase  60.76 
 
 		 450 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0193  glutamate dehydrogenase  60.59 
 
 		 449 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4089  glutamate dehydrogenase  58.88 
 
 		 447 aa  539  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0175  glutamate dehydrogenase  60.81 
 
 		 449 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000304056 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0864  glutamate dehydrogenase  61.43 
 
 		 448 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.342064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4036  glutamate dehydrogenase  58.88 
 
 		 447 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1286  glutamate dehydrogenase  59.95 
 
 		 447 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000501948  hitchhiker  0.000436028 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3000  glutamate dehydrogenase  61.14 
 
 		 448 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.741284  normal  0.619757 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000352  NADP-specific glutamate dehydrogenase  60.8 
 
 		 450 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0119  glutamate dehydrogenase  58.88 
 
 		 447 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4267  glutamate dehydrogenase  58.61 
 
 		 448 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4353  glutamate dehydrogenase  58.61 
 
 		 448 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  0.0129009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4646  glutamate dehydrogenase  58.61 
 
 		 448 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1219  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  59.3 
 
 		 456 aa  534  1e-150  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128767  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1895  glutamate dehydrogenase  59.34 
 
 		 450 aa  534  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2189  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  60.53 
 
 		 451 aa  529  1e-149  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0418  glutamate dehydrogenase  59.06 
 
 		 449 aa  529  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1815  glutamate dehydrogenase  58.46 
 
 		 452 aa  530  1e-149  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0302  glutamate dehydrogenase  61.43 
 
 		 449 aa  525  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0060  glutamate dehydrogenase  58.14 
 
 		 449 aa  525  1e-148  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.742683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>