61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1310 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1310  17 kDa surface antigen  100 
 
 
159 aa  308  1e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.13567 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1151  17 kDa surface antigen  32.69 
 
 
154 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.965272  normal  0.0962172 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3852  lipoprotein SlyB, putative  34.62 
 
 
154 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.782854 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  37.14 
 
 
155 aa  57.4  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4325  hypothetical protein  32.69 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.138091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50740  hypothetical protein  32.69 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00688218 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3682  outer membrane lipoprotein  35.54 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  36.77 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1167  17 kDa surface antigen  32.69 
 
 
154 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1131  17 kDa surface antigen  32.69 
 
 
154 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40399  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4284  17 kDa surface antigen  32.69 
 
 
154 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1231  surface antigen protein  32.69 
 
 
154 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.302793  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0116  17 kDa surface antigen  32.72 
 
 
157 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.72771  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0568  17 kDa surface antigen  32.72 
 
 
157 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  decreased coverage  0.000059328 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0599  17 kDa surface antigen  32.72 
 
 
157 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.181181  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0525  17 kDa surface antigen  32.72 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  39.5 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0501  17 kDa surface antigen  32.72 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.354763  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  39.5 
 
 
165 aa  50.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  40.74 
 
 
225 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  42.37 
 
 
257 aa  48.9  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  42.37 
 
 
257 aa  48.9  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  42.86 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  42.86 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  42.86 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  42.86 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  42.86 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  42.86 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2468  17 kDa surface antigen  29.93 
 
 
156 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000341658  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  42.86 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  26.57 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2215  17 kDa surface antigen  35.71 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.443445  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  48.21 
 
 
179 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0470  17 kDa surface antigen  31.08 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000215158  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  41.27 
 
 
179 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  41.94 
 
 
178 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4115  lipoprotein SlyB, putative  34.62 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.404382  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  46.43 
 
 
179 aa  44.3  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6520  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  25.95 
 
 
153 aa  44.3  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  41.27 
 
 
179 aa  43.9  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  41.27 
 
 
179 aa  43.9  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  41.27 
 
 
179 aa  43.9  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  41.27 
 
 
179 aa  43.9  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0526  putative outer membrane lipoprotein, SlyB-like  30.72 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0527356  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3177  17 kDa surface antigen  37.96 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  32.41 
 
 
216 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  39.44 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2871  17 kDa surface antigen-like protein  32.21 
 
 
155 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000441534  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3432  17 kDa surface antigen  30.72 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0130273 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  32.64 
 
 
215 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  32.64 
 
 
215 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19520  outer membrane lipoprotein  29.49 
 
 
154 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1652  17 kDa surface antigen  28.24 
 
 
156 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000172178  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1727  17 kDa surface antigen  29.1 
 
 
156 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000263697  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  25.6 
 
 
164 aa  41.6  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536943  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3449  17 kDa surface antigen  28.57 
 
 
157 aa  41.2  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499306  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  37.11 
 
 
206 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5596  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  26.03 
 
 
153 aa  40.8  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  26.72 
 
 
158 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  0.0000108744 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2622  hypothetical protein  27.48 
 
 
156 aa  40.4  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1757  17 kDa surface antigen  28.24 
 
 
147 aa  40.4  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000073012  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>