More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1096 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1096  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 474 aa  954    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000220234  hitchhiker  0.0000128314 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3474  transcription termination factor Rho  47.99 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1456  transcription termination factor Rho  47.29 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00134709  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  46.98 
 
 		 503 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3932  transcription termination factor Rho  47.36 
 
 		 421 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713144  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4258  transcription termination factor Rho  47.36 
 
 		 421 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.884099 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1562  transcription termination factor Rho  46.35 
 
 		 449 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.135636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1503  transcription termination factor Rho  47.2 
 
 		 548 aa  384  1e-105  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000037905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  47.12 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1756  transcription termination factor Rho  48.34 
 
 		 429 aa  385  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.147978  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  46.76 
 
 		 422 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0856  transcription termination factor Rho  47.12 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.447055  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2322  transcription termination factor Rho  46.86 
 
 		 421 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  47.33 
 
 		 416 aa  385  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2970  transcription termination factor Rho  46.15 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0605  transcription termination factor Rho  48.9 
 
 		 447 aa  381  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000783157  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0778  transcription termination factor Rho  50 
 
 		 419 aa  381  1e-104  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0424  transcription termination factor Rho  47.74 
 
 		 429 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00623615  normal  0.0254414 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00336  transcription termination factor Rho  46.49 
 
 		 419 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1231  transcription termination factor Rho  46.75 
 
 		 422 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287939  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2085  transcription termination factor Rho  48.18 
 
 		 419 aa  379  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0393  transcription termination factor Rho  47.6 
 
 		 421 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2892  transcription termination factor Rho  46.75 
 
 		 422 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0391  transcription termination factor Rho  47.74 
 
 		 429 aa  381  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575661  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0292  transcription termination factor Rho  47.36 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0428  transcription termination factor Rho  47.36 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2668  transcription termination factor Rho  46.75 
 
 		 422 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.169241  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  47.2 
 
 		 415 aa  382  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0298  transcription termination factor Rho  47.36 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3206  transcription termination factor Rho  46.88 
 
 		 421 aa  381  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4391  transcription termination factor Rho  46.63 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  48.42 
 
 		 415 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  47.93 
 
 		 415 aa  378  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  46.75 
 
 		 419 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1282  transcription termination factor Rho  46.3 
 
 		 430 aa  378  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0183251  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0056  transcription termination factor Rho  46.73 
 
 		 418 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.624347  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0443  transcription termination factor Rho  45.15 
 
 		 447 aa  375  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0265285  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  48.18 
 
 		 415 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002098  transcription termination factor Rho  46.49 
 
 		 419 aa  378  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000734863  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  46.49 
 
 		 418 aa  376  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0100  transcription termination factor Rho  46.39 
 
 		 421 aa  375  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  46.49 
 
 		 418 aa  376  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2592  transcription termination factor Rho  46.73 
 
 		 418 aa  375  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00987626  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  47.45 
 
 		 415 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  48.18 
 
 		 415 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0323  transcription termination factor Rho  47.98 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0180092  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  47.46 
 
 		 418 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2196  transcription termination factor Rho  46.49 
 
 		 420 aa  378  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.430526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1344  transcription termination factor Rho  47.68 
 
 		 431 aa  375  1e-103  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000288127  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  46.75 
 
 		 419 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0148  transcription termination factor Rho  46.73 
 
 		 419 aa  375  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00136527  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  48.18 
 
 		 415 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2262  transcription termination factor Rho  46.49 
 
 		 420 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.883026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5019  transcription termination factor Rho  46.43 
 
 		 473 aa  378  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000339489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0108  transcription termination factor Rho  47.12 
 
 		 421 aa  378  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.411018  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  48.17 
 
 		 415 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2863  transcription termination factor Rho  45.78 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.799607  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2845  transcription termination factor Rho  46.49 
 
 		 418 aa  378  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  0.0341841 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  46.75 
 
 		 419 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  46.75 
 
 		 419 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  47.69 
 
 		 415 aa  375  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1984  transcription termination factor Rho  47.22 
 
 		 418 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  46 
 
 		 419 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0470  transcription termination factor Rho  45.74 
 
 		 414 aa  374  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000467448  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3453  transcription termination factor Rho  46.02 
 
 		 423 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1292  transcription termination factor Rho  46.62 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.345721  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  46.51 
 
 		 419 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1173  transcription termination factor Rho  46.38 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.114801  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0427  transcription termination factor Rho  47.03 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3002  transcription termination factor Rho  45.76 
 
 		 420 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2863  transcription termination factor Rho  45.76 
 
 		 420 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  46.51 
 
 		 419 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1260  transcription termination factor Rho  45.65 
 
 		 422 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0037  transcription termination factor Rho  46.97 
 
 		 419 aa  374  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.245355 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4288  transcription termination factor Rho  46.15 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0673197 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0009  transcription termination factor Rho  46.89 
 
 		 421 aa  375  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000017892  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2217  transcription termination factor Rho  46.25 
 
 		 420 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0809447  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0120  transcription termination factor Rho  45.78 
 
 		 418 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2699  transcription termination factor Rho  46 
 
 		 419 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000370225  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1500  transcription termination factor Rho  46.25 
 
 		 420 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0572  transcription termination factor Rho  46.62 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.124184  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0274  transcription termination factor Rho  48.17 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000543073  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  46 
 
 		 419 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  48.18 
 
 		 415 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1421  transcription termination factor Rho  48.41 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0002  transcription termination factor Rho  45.54 
 
 		 434 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303251  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0163  transcription termination factor Rho  46.63 
 
 		 421 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0042  transcription termination factor Rho  46 
 
 		 420 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133554  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2358  transcription termination factor Rho  46 
 
 		 420 aa  371  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.139464  normal  0.694538 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0949  transcription termination factor Rho  46.25 
 
 		 420 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.545356 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1855  transcription termination factor Rho  46 
 
 		 420 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0803  transcription termination factor Rho  43.3 
 
 		 469 aa  369  1e-101  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0631326  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3991  transcription termination factor Rho  46 
 
 		 421 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0198  transcription termination factor Rho  46.35 
 
 		 402 aa  371  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2290  transcription termination factor Rho  45.76 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000767102  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00570  transcription termination factor Rho  45.76 
 
 		 421 aa  371  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.576624  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4906  transcription termination factor Rho  45.76 
 
 		 420 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.957069 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1126  transcription termination factor Rho  46 
 
 		 420 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722702  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1226  transcription termination factor Rho  47.14 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0393  transcription termination factor Rho  47 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.023811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>