27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0371 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0371  two component regulator propeller domain protein  100 
 
 		 858 aa  1785    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000833804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  24.34 
 
 		 1105 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  25 
 
 		 1370 aa  57.4  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  26.17 
 
 		 1346 aa  56.6  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02778  GGDEF protein  22.75 
 
 		 946 aa  55.5  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4115  two component regulator propeller domain-containing protein  38.14 
 
 		 357 aa  55.1  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0684737 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0790  two component regulator propeller domain-containing protein  35.64 
 
 		 692 aa  53.9  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3042  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.58 
 
 		 1181 aa  53.9  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.227036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  23.87 
 
 		 1407 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  23.4 
 
 		 1388 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  24.93 
 
 		 1373 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  22.04 
 
 		 1378 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  21.43 
 
 		 1397 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4114  two component regulator propeller domain-containing protein  32.41 
 
 		 377 aa  50.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0168145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  23.24 
 
 		 1355 aa  48.1  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  22.26 
 
 		 1351 aa  47.8  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  28.97 
 
 		 1250 aa  47.8  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  31.4 
 
 		 1378 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  22.07 
 
 		 1086 aa  47.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 1242 aa  45.8  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  24.34 
 
 		 1316 aa  45.8  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  24.02 
 
 		 1374 aa  45.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  27.61 
 
 		 695 aa  45.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  23.03 
 
 		 1118 aa  45.1  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  27.12 
 
 		 1093 aa  44.7  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 1030 aa  44.3  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223882  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3424  GGDEF domain-containing protein  23.84 
 
 		 1502 aa  44.3  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>