87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0204 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0204  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  100 
 
 
554 aa  1115    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.928975 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3314  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  74.76 
 
 
416 aa  468  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1850  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  54.14 
 
 
371 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1201  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  59.55 
 
 
516 aa  364  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0064  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  59.43 
 
 
458 aa  358  9.999999999999999e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000825924  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0809  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  58.33 
 
 
516 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.61044  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1492  glutaconyl-CoA decarboxylase beta subunit  52.14 
 
 
370 aa  353  4e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0159163 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2892  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  61.92 
 
 
378 aa  352  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0351319  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0917  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  58.12 
 
 
519 aa  350  3e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1266  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  57.05 
 
 
516 aa  350  4e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2434  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  59.81 
 
 
360 aa  348  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13524  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0640  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  56.05 
 
 
376 aa  347  2e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0605  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  59.6 
 
 
436 aa  346  7e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0086  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  54.87 
 
 
376 aa  342  8e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.923092  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1050  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  58.39 
 
 
377 aa  342  9e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3375  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  54.87 
 
 
376 aa  341  2e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002526  oxaloacetate decarboxylase beta chain  54.28 
 
 
376 aa  340  5.9999999999999996e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03490  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  54.28 
 
 
376 aa  339  5.9999999999999996e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0694  oxaloacetate decarboxylase  56.07 
 
 
440 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00230113  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1258  pyruvate carboxylase/oxaloacetate decarboxylase biotin carboxyl carrier subunit alpha  58.28 
 
 
443 aa  339  8e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.913134  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0294  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  54.31 
 
 
374 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0972  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  59.11 
 
 
444 aa  336  5e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.377854  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1366  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  56.29 
 
 
371 aa  337  5e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0970763  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0886  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  52.35 
 
 
378 aa  336  5.999999999999999e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02840  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  56.45 
 
 
376 aa  332  1e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1434  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  51.75 
 
 
378 aa  330  4e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0944  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  55.33 
 
 
374 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3011  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  53.1 
 
 
376 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2479  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  60.32 
 
 
375 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.231927  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2282  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  51.48 
 
 
376 aa  327  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1666  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  54.1 
 
 
378 aa  323  6e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1307  oxaloacetate decarboxylase  58.79 
 
 
420 aa  321  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0998305  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1310  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  52.79 
 
 
383 aa  321  3e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3542  oxaloacetate decarboxylase beta chain  63.73 
 
 
433 aa  320  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.069232  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3335  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  55.26 
 
 
376 aa  319  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107525 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1053  oxaloacetate decarboxylase  57.88 
 
 
376 aa  318  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3673  glutaconyl-CoA decarboxylase  51.2 
 
 
376 aa  318  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.523011  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3622  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  51.72 
 
 
390 aa  318  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000349445  hitchhiker  0.000000446411 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0061  oxaloacetate decarboxylase beta chain  63.73 
 
 
433 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1067  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  57.78 
 
 
376 aa  317  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1322  glutaconyl-CoA decarboxylase  58.52 
 
 
376 aa  317  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0119077 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0059  oxaloacetate decarboxylase beta chain  63.39 
 
 
433 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.132607 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0895  oxaloacetate decarboxylase subunit beta  63.73 
 
 
433 aa  317  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0047  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  47.26 
 
 
374 aa  316  5e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3711  oxaloacetate decarboxylase beta chain  63.73 
 
 
433 aa  316  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0060  oxaloacetate decarboxylase beta chain  63.39 
 
 
433 aa  316  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0058  oxaloacetate decarboxylase subunit beta  63.73 
 
 
433 aa  316  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3649  oxaloacetate decarboxylase subunit beta  63.39 
 
 
433 aa  316  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3614  oxaloacetate decarboxylase beta chain  63.39 
 
 
433 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0047  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  46.97 
 
 
374 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0059  oxaloacetate decarboxylase beta chain  63.05 
 
 
433 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.566525 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0804  oxaloacetate decarboxylase beta chain  63.39 
 
 
433 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1200  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  54.09 
 
 
376 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0832  oxaloacetate decarboxylase beta chain  63.39 
 
 
433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1898  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  51.49 
 
 
378 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1221  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  57.46 
 
 
377 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.949455  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1275  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  52.92 
 
 
376 aa  314  2.9999999999999996e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1031  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  55.43 
 
 
376 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.634771  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0863  oxaloacetate decarboxylase beta chain  63.39 
 
 
433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1741  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  53.67 
 
 
376 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1127  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  58.52 
 
 
376 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1026  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  58.52 
 
 
376 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1093  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  58.52 
 
 
376 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3543  oxaloacetate decarboxylase beta chain  63.05 
 
 
433 aa  313  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0319  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  59.09 
 
 
433 aa  312  7.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3197  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  56.63 
 
 
379 aa  311  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107579  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3067  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  57.23 
 
 
376 aa  312  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.738311 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3265  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  58.2 
 
 
376 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2985  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  56.91 
 
 
376 aa  311  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.733812 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3164  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  56.91 
 
 
376 aa  311  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0509  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  54.24 
 
 
359 aa  310  5.9999999999999995e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1608  methylmalonyl-CoA decarboxylase, beta subunit  55.22 
 
 
383 aa  310  5.9999999999999995e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3585  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  51.62 
 
 
379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.330233  normal  0.310791 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0203  oxaloacetate decarboxylase beta subunit  57.8 
 
 
421 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1820  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  54.1 
 
 
376 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0241  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  52.86 
 
 
382 aa  306  6e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.140679  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0953  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  52.54 
 
 
376 aa  300  6e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.126318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3692  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  51.86 
 
 
376 aa  296  7e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0136998 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0996  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  44.1 
 
 
388 aa  295  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0382  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  53.55 
 
 
385 aa  290  4e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.159911  normal  0.654104 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1925  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  46.56 
 
 
380 aa  273  7e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1756  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  34.95 
 
 
375 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3300  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  33.1 
 
 
404 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1055  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  32.18 
 
 
404 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1320  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  29.76 
 
 
403 aa  126  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3311  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  33.57 
 
 
419 aa  126  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2305  pyruvate carboxyltransferase  70.67 
 
 
216 aa  100  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>