More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0094 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0094  ribosomal protein S18  100 
 
 		 81 aa  162  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  49.18 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2008  30S ribosomal protein S18  45.68 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.922346  normal  0.649382 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2592  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  57.69 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  57.69 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  57.69 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  57.69 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0596  30S ribosomal protein S18  53.06 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  54 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1137  30S ribosomal protein S18  52.83 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1337  30S ribosomal protein S18  52.83 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0009  30S ribosomal protein S18  55.1 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.99289  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0902  30S ribosomal protein S18  49.06 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09983  ribosomal protein S18  53.06 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.596989  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  46.88 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0113  30S ribosomal protein S18  62.79 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1776  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000252079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0740  ribosomal protein S18  53.06 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0452122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1321  30S ribosomal protein S18  50.94 
 
 		 71 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0398  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 83 aa  57  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3729  30S ribosomal protein S18  47.17 
 
 		 72 aa  57  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 81 aa  57  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14781  30S ribosomal protein S18  50.94 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.120716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0600  30S ribosomal protein S18  64.44 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000175941  unclonable  0.00000679911 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1123  30S ribosomal protein S18  50.94 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.561974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3481  30S ribosomal protein S18  53.06 
 
 		 98 aa  57  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.26859  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0829  ribosomal protein S18  62.22 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10131  30S ribosomal protein S18  50.94 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.249582  hitchhiker  0.00103726 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0340  30S ribosomal protein S18  50.94 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.042391  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1479  ribosomal protein S18  48.08 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1667  30S ribosomal protein S18  51.02 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088074  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5173  30S ribosomal protein S18  49.06 
 
 		 71 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  51.92 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1669  30S ribosomal protein S18  45.9 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1687  30S ribosomal protein S18  45.9 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09911  30S ribosomal protein S18  49.06 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09501  30S ribosomal protein S18  49.06 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0932  30S ribosomal protein S18  49.06 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0943286  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09931  30S ribosomal protein S18  49.06 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3096  30S ribosomal protein S18  50.82 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  51.92 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08951  30S ribosomal protein S18  50.94 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.519961  decreased coverage  0.000000161977 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0012  30S ribosomal protein S18  48.08 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0166504  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0782  30S ribosomal protein S18  50.98 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.04238  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6994  ribosomal protein S18  48.98 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0167  ribosomal protein S18  48.08 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000272348  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2037  ribosomal protein S18  43.48 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166902  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  51.92 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  46.15 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3903  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000287817  normal  0.152503 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  48.08 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1113  ribosomal protein S18  41.79 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321408  normal  0.83859 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0449  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000993889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  48.08 
 
 		 88 aa  52.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0694  30S ribosomal protein S18  43.64 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.276766  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  46 
 
 		 75 aa  52  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0309  30S ribosomal protein S18  43.64 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  48 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3677  30S ribosomal protein S18  51.02 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0799478  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29387  Putative mitochondrial ribosomal protein S18  44.23 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.222874 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1477  30S ribosomal protein S18  48.98 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00897037 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2763  30S ribosomal protein S18  48.98 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1511  30S ribosomal protein S18  45.59 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0417  ribosomal protein S18  53.66 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225211  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2023  30S ribosomal protein S18  45.45 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.344457  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1058  30S ribosomal protein S18  48.98 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1415  30S ribosomal protein S18  45.31 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1211  SSU ribosomal protein S18P  46.94 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114712  normal  0.854081 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3039  30S ribosomal protein S18  44.12 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.230428 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3928  30S ribosomal protein S18  53.66 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0755  30S ribosomal protein S18  53.66 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000506389  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1382  ribosomal protein S18  46 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3641  30S ribosomal protein S18  53.66 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000922351  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0713  30S ribosomal protein S18  53.66 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348938  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0517  30S ribosomal protein S18  53.66 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.370813  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0743  30S ribosomal protein S18  53.66 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000702658  hitchhiker  0.000126667 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0734  30S ribosomal protein S18  53.66 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213573  hitchhiker  0.0000000101296 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3258  30S ribosomal protein S18  53.66 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000185776  hitchhiker  0.00000962833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0689  30S ribosomal protein S18  53.66 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00223713  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0331  30S ribosomal protein S18  43.64 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000798674  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  60.98 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0703  30S ribosomal protein S18  53.66 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000172761  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  53.66 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>