More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0002 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0002  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 
468 aa  963    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.504592  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.61 
 
 
467 aa  355  8.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.26 
 
 
454 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  36.52 
 
 
446 aa  323  4e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  37.39 
 
 
453 aa  322  6e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  37.39 
 
 
453 aa  322  6e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.49 
 
 
449 aa  322  7e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.98 
 
 
446 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  37.69 
 
 
451 aa  321  9.999999999999999e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.36 
 
 
444 aa  321  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  36.11 
 
 
450 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  36.93 
 
 
446 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  36.93 
 
 
446 aa  320  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  36.93 
 
 
446 aa  320  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  36.93 
 
 
446 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  36.93 
 
 
446 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  36.7 
 
 
442 aa  320  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  36.34 
 
 
446 aa  319  7e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  36.44 
 
 
450 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  36.64 
 
 
446 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  36.34 
 
 
446 aa  318  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  36.64 
 
 
446 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  36.5 
 
 
446 aa  317  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.76 
 
 
453 aa  317  3e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  44.12 
 
 
457 aa  316  5e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  43.82 
 
 
457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.78 
 
 
463 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  36.13 
 
 
441 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  35.85 
 
 
449 aa  306  7e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  37.01 
 
 
443 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  41.62 
 
 
440 aa  302  9e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  37.15 
 
 
445 aa  298  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  35.41 
 
 
452 aa  296  7e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  35.43 
 
 
445 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  35.45 
 
 
443 aa  294  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1436  chromosomal replication initiation protein  42.9 
 
 
500 aa  293  5e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  34.48 
 
 
492 aa  293  6e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  35.81 
 
 
450 aa  292  8e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  34.56 
 
 
460 aa  292  8e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.11 
 
 
453 aa  292  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  33.76 
 
 
459 aa  290  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  33.84 
 
 
458 aa  290  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.7 
 
 
443 aa  289  6e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0001  chromosomal replication initiation protein  37.55 
 
 
477 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.839498  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.14 
 
 
450 aa  288  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  34.19 
 
 
436 aa  286  5e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  36.97 
 
 
478 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0001  chromosomal replication initiation protein  35.55 
 
 
487 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605191  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0001  chromosomal replication initiation protein  34.54 
 
 
491 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.96301  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0045  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.56 
 
 
539 aa  283  5.000000000000001e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0001  chromosomal replication initiation protein  34.62 
 
 
490 aa  283  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2133  chromosomal replication initiation protein  34.83 
 
 
489 aa  282  8.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000845727  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.15 
 
 
456 aa  282  9e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.38 
 
 
515 aa  281  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.62 
 
 
469 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280164  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0001  chromosomal replication initiation protein  34.39 
 
 
492 aa  279  7e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.983579  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  34.73 
 
 
459 aa  279  8e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.49 
 
 
566 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000150843  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  34.58 
 
 
460 aa  278  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  34.58 
 
 
460 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  44.16 
 
 
461 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  0.000000603983 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  34.81 
 
 
462 aa  278  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  35.27 
 
 
481 aa  277  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  34.36 
 
 
460 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  34.58 
 
 
460 aa  278  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  34.28 
 
 
462 aa  276  5e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.34 
 
 
480 aa  276  6e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0001  chromosomal replication initiation protein  32.76 
 
 
491 aa  276  7e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.72 
 
 
587 aa  276  7e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0001  DNA replication initiation ATPase- like protein  42.25 
 
 
582 aa  276  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00000523076  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.14 
 
 
447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.35 
 
 
527 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  34.21 
 
 
462 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  34.21 
 
 
462 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  35.06 
 
 
451 aa  274  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  35.06 
 
 
451 aa  274  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  34.21 
 
 
462 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  34.21 
 
 
462 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0002  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.98 
 
 
452 aa  274  3e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000136146 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.31 
 
 
454 aa  273  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0001  chromosomal replication initiation protein  42.2 
 
 
557 aa  274  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  34.36 
 
 
461 aa  274  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  36.23 
 
 
448 aa  273  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  33.92 
 
 
462 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  33.55 
 
 
461 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0001  chromosomal replication initiation protein  32.75 
 
 
469 aa  273  5.000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00010  chromosomal replication initiation protein  41.99 
 
 
597 aa  273  6e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000000278732  normal  0.616682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.41 
 
 
591 aa  273  6e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  33.41 
 
 
461 aa  273  7e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.69 
 
 
480 aa  272  9e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0206444  normal  0.0774659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.15 
 
 
570 aa  272  9e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000116219  normal  0.231349 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.33 
 
 
534 aa  271  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  34.77 
 
 
472 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0001  chromosomal replication initiation protein  35.28 
 
 
464 aa  271  2e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000013935  decreased coverage  1.67388e-26 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.27 
 
 
447 aa  271  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0270  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
452 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.43885  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0001  chromosomal replication initiation protein  37.7 
 
 
579 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.97 
 
 
475 aa  270  4e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.202829  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1342  chromosomal replication initiation protein  44.41 
 
 
455 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  34.22 
 
 
457 aa  270  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>