10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6721 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6721  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  277  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02900  hypothetical protein  50.39 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00721507  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0672  hypothetical protein  31.21 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0682  putative transmembrane protein  34.01 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0695  putative transmembrane protein  34.01 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.120229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0675  putative transmembrane protein  34.01 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4576  hypothetical protein  46.58 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0062  putative transmembrane protein  37.67 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10524  transmembrane protein  30.87 
 
 		 182 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1020  hypothetical protein  32.54 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.349595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>