14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6219 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6219  hypothetical protein  100 
 
 		 596 aa  1130    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6867  hypothetical protein  28.38 
 
 		 494 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.315159  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25000  hypothetical protein  35.17 
 
 		 190 aa  76.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0150  hypothetical protein  25.23 
 
 		 448 aa  72  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35680  hypothetical protein  24.85 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.294779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3952  hypothetical protein  28.74 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0654267  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6401  hypothetical protein  28.03 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01860  hypothetical protein  26.73 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.828585 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38930  hypothetical protein  23.84 
 
 		 500 aa  60.8  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.389828  normal  0.203227 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6817  hypothetical protein  28.17 
 
 		 565 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  39.13 
 
 		 1821 aa  50.4  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1532  hypothetical protein  28.05 
 
 		 417 aa  45.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180005  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3484  hypothetical protein  33.66 
 
 		 383 aa  44.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442596  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4519  hypothetical protein  22.67 
 
 		 440 aa  44.3  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00148768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>