47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5239 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5239  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  197  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15610  hypothetical protein  92.38 
 
 		 105 aa  143  8.000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.167288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1860  hypothetical protein  71.84 
 
 		 105 aa  140  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.39326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1853  hypothetical protein  71.84 
 
 		 105 aa  140  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2344  hypothetical protein  86.41 
 
 		 104 aa  131  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2369  MIHF  85.44 
 
 		 105 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0348363  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2416  MihF  85.44 
 
 		 105 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.623884  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2666  MihF  85.44 
 
 		 105 aa  130  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2410  MihF  85.44 
 
 		 105 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3741  MihF  84.47 
 
 		 105 aa  128  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11417  integration host factor mihF  85.29 
 
 		 190 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282847  normal  0.291955 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2579  putative integration host factor  83.5 
 
 		 104 aa  126  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130539  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1061  hypothetical protein  71.43 
 
 		 105 aa  122  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3196  putative integration host factor MihF  73.53 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.242589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1712  integration host factor-like protein  72.55 
 
 		 106 aa  120  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4163  hypothetical protein  80.39 
 
 		 104 aa  120  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1563  normal  0.37873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2812  hypothetical protein  70.19 
 
 		 107 aa  120  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2435  hypothetical protein  61.17 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3008  hypothetical protein  71.15 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000974881  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3098  hypothetical protein  63.73 
 
 		 101 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1359  hypothetical protein  70.19 
 
 		 107 aa  117  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19805  normal  0.0604733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3128  hypothetical protein  70.48 
 
 		 116 aa  110  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.168775  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1319  hypothetical protein  57.84 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129436  normal  0.2348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3156  hypothetical protein  70.48 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  hitchhiker  0.0000150374 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0809  hypothetical protein  58.59 
 
 		 102 aa  107  7.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0768002  normal  0.858288 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1661  hypothetical protein  59.6 
 
 		 102 aa  107  8.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371749  hitchhiker  0.0000841753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5346  hypothetical protein  65.69 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14790  hypothetical protein  58.88 
 
 		 108 aa  98.2  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.469927  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2993  hypothetical protein  64.71 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.65036 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1696  hypothetical protein  58.82 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.877224  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1294  putative integration host factor MihF  62.5 
 
 		 113 aa  94.7  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.203046  normal  0.0715568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1864  integration host factor  55 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1849  hypothetical protein  60.78 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.317329  normal  0.137078 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07810  hypothetical protein  58.59 
 
 		 102 aa  90.5  7e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.175394  normal  0.797766 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18020  hypothetical protein  58.82 
 
 		 106 aa  89.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00327498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2041  hypothetical protein  58.82 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.537681  hitchhiker  0.00591086 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11900  hypothetical protein  57.58 
 
 		 102 aa  87.4  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000932793  normal  0.0171922 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1714  hypothetical protein  54.43 
 
 		 80 aa  85.9  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0927785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3448  hypothetical protein  47.12 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33240  hypothetical protein  52.53 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2260  putative integration host factor IHF  53.33 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.46856  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12710  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0463914  normal  0.0241518 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1997  putative integration host factor IHF  57.75 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000128008 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0876  hypothetical protein  42.86 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3207  hypothetical protein  35.42 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426307  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12560  hypothetical protein  44.58 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.588168  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40034  ABC(ATP-binding) family transporter  32.26 
 
 		 360 aa  41.2  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>