More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5032 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5032  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
260 aa  513  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0569591  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11010  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  51.58 
 
 
236 aa  203  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11130  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  47.23 
 
 
282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1589  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.61 
 
 
268 aa  198  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0835232  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3294  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.18 
 
 
267 aa  193  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67887  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2313  phospholipid/glycerol acyltransferase  50.24 
 
 
242 aa  191  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000801827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8044  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.44 
 
 
284 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2794  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.77 
 
 
284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.117453 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2293  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.37 
 
 
251 aa  187  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1683  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.67 
 
 
259 aa  186  4e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.837761  normal  0.0100169 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1588  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.96 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3457  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.7 
 
 
249 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8011  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.17 
 
 
237 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1122  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.51 
 
 
275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.291999  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1156  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.44 
 
 
241 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  unclonable  0.0000000437844 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08770  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.97 
 
 
224 aa  170  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0458542  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2516  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.43 
 
 
248 aa  169  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.366309  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1265  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.48 
 
 
236 aa  166  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.769148  normal  0.867534 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0630  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.52 
 
 
250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889046  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2253  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.51 
 
 
257 aa  165  9e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000990177 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09120  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.57 
 
 
256 aa  155  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18520  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.82 
 
 
267 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0189  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.74 
 
 
281 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4048  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.73 
 
 
271 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.141226  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4990  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.09 
 
 
257 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.300338  normal  0.19338 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1483  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.17 
 
 
267 aa  149  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.788299  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5999  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.18 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3722  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.62 
 
 
230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  0.164305 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0795  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.49 
 
 
246 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2483  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.89 
 
 
255 aa  123  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2340  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.07 
 
 
276 aa  122  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00816497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5805  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.3 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3235  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.68 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  0.0303582 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0559  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.2 
 
 
219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2674  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.8 
 
 
236 aa  112  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0978723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6059  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.16 
 
 
284 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3040  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.21 
 
 
236 aa  108  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1851  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.38 
 
 
223 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1153  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.7 
 
 
262 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490723  normal  0.0562479 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0713  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.58 
 
 
203 aa  106  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107565  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3044  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.73 
 
 
238 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000160916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5113  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.18 
 
 
275 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5406  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.18 
 
 
275 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.729439 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06320  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.25 
 
 
223 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1313  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.49 
 
 
258 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0173307  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25220  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.94 
 
 
295 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.686471  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2706  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.43 
 
 
235 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0764625  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4063  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphateacyltransferase- li ke  40.1 
 
 
216 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0757606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3277  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.55 
 
 
239 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1552  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 
267 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.573165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3339  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.55 
 
 
239 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3288  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.55 
 
 
239 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1369  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.62 
 
 
239 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5025  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.16 
 
 
265 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13770  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.5 
 
 
235 aa  102  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0506817  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3562  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.36 
 
 
242 aa  102  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2067  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.25 
 
 
264 aa  102  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.488954  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1345  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.66 
 
 
197 aa  102  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00444986  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2550  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.1 
 
 
232 aa  102  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.570602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1392  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.54 
 
 
245 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0315769  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1728  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.09 
 
 
220 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.855894  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0179  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.71 
 
 
213 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196105  normal  0.76032 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2700  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.29 
 
 
286 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.258633  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15790  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.82 
 
 
259 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251434  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3865  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.72 
 
 
232 aa  99.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243081  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2000  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.32 
 
 
252 aa  99.8  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0595914  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5656  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.61 
 
 
262 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1417  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.92 
 
 
234 aa  99.4  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.613743  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4692  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.06 
 
 
258 aa  99.4  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3544  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.07 
 
 
240 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.707443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3941  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.25 
 
 
242 aa  99  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360639  normal  0.069629 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13610  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.98 
 
 
264 aa  98.6  9e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.410928  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14270  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.85 
 
 
244 aa  98.2  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.201477  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3128  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.08 
 
 
284 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.520378  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1439  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.195165  normal  0.358229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5530  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.5 
 
 
313 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0458  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.87 
 
 
216 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2170  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.38 
 
 
193 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000489643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2197  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.04 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2967  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.12 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5951  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.18 
 
 
244 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1494  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.76 
 
 
221 aa  96.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22937  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3227  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.14 
 
 
252 aa  97.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123121  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1036  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.55 
 
 
272 aa  96.3  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3486  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.26 
 
 
232 aa  96.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.530273  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0053  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.78 
 
 
214 aa  96.3  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.639478  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6379  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.72 
 
 
229 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.649395  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0454  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.85 
 
 
197 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1457  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.08 
 
 
225 aa  94.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.211879  normal  0.0393142 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2021  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.53 
 
 
237 aa  94  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187124  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1252  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.23 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3088  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.38 
 
 
293 aa  94  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.440706  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4936  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.29 
 
 
245 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  0.754378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2307  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.91 
 
 
246 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3260  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.92 
 
 
258 aa  94  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1173  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.24 
 
 
250 aa  92.4  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.336422  normal  0.164625 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13850  acyltransferase  35.76 
 
 
259 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.523346 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1904  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.98 
 
 
264 aa  92  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0167165  hitchhiker  0.000224701 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24820  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.94 
 
 
253 aa  92  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.56063  normal  0.801027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1829  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.51 
 
 
303 aa  92  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428593  normal  0.192402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>