More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2208 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2208  response regulator receiver protein  100 
 
 		 134 aa  259  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3140  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 128 aa  87.8  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3504  response regulator receiver protein  41.94 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1891  response regulator  34.48 
 
 		 379 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.750204  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0239  response regulator receiver domain-containing protein  31.45 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3993  response regulator receiver protein  29.84 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0199898 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1722  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000956357 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2419  response regulator receiver domain-containing protein  32.26 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.730066  hitchhiker  0.0000120546 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1694  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.14 
 
 		 472 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1042  two component signal transduction response regulator  41.32 
 
 		 465 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.472622  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0213  response regulator receiver domain-containing protein  38.26 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1428  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 460 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2946  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1519  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.043846  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0856  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0534273 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0702  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 460 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 509 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1522  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.62 
 
 		 461 aa  67  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1161  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.2 
 
 		 941 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4105  response regulator receiver domain-containing protein  36.67 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0374743 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0215  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.46 
 
 		 528 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0571306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4314  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2443  putative chemotaxis response regulator, CheY5  34.58 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.451762  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3647  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 471 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0209004  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  31.97 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2694  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.76 
 
 		 461 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.62039e-17 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1107  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  32.5 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  32.77 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0252  response regulator receiver protein  35 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.114255 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  38.1 
 
 		 457 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1469  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1423  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4550  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  37.04 
 
 		 255 aa  64.7  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  26.27 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 457 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 511 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2806  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 450 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0963  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  29.66 
 
 		 467 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1787  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2924  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 470 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.777319  hitchhiker  0.0000000000564278 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1685  two component Fis family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 457 aa  63.9  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529377  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2633  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.55 
 
 		 467 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  28.46 
 
 		 225 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  32.5 
 
 		 225 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2748  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.85 
 
 		 233 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  32.77 
 
 		 254 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 225 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3011  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.85 
 
 		 233 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  32.77 
 
 		 254 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2506  histidine kinase  35 
 
 		 538 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.971833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2392  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.83 
 
 		 458 aa  63.9  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0321511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0241  LuxR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 216 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1627  response regulator receiver domain-containing protein  31.97 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.113437 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1522  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 227 aa  63.5  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1644  two component transcriptional regulator  37.07 
 
 		 235 aa  63.5  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0460  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.903697  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1999  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 481 aa  63.5  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0598  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  34.45 
 
 		 470 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_004310  BR1521  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  37.07 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  32.77 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3719  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.173125  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  32.77 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0639  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1472  putative transcriptional regulatory protein OmpR  37.07 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.830233  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0684  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 456 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3111  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 458 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3665  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3443  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1657  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 459 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000574549  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1472  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413604  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1969  sigma-54 dependent transcriptional regulator/response regulator  34.21 
 
 		 473 aa  62.4  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.440374  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  33.65 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  36.54 
 
 		 391 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 508 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  34.31 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7251  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  29.73 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3850  two component LuxR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 1234 aa  62  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0673  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.26 
 
 		 457 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0911  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 456 aa  62  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1055  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 456 aa  62  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.523432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0673  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.26 
 
 		 458 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0097  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.29 
 
 		 448 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  35.29 
 
 		 912 aa  62  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4585  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.47 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.209184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.05 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  37.3 
 
 		 457 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  38.14 
 
 		 123 aa  62  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1386  two component transcriptional regulator  35.9 
 
 		 241 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  34.62 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3383  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 475 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.542066  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>