14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0429 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0429  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0881572  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34530  hypothetical protein  60 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0098  hypothetical protein  42.86 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0571  putative tuberculin related peptide  35.23 
 
 		 153 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0583  putative tuberculin related peptide  35.23 
 
 		 153 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568486  hitchhiker  0.00756826 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0561  putative tuberculin related peptide  35.23 
 
 		 152 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10436  tuberculin-like peptide  37.5 
 
 		 164 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.232038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0180  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323163  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0891  hypothetical protein  27.72 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0777  hypothetical protein  34.38 
 
 		 416 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3990  hypothetical protein  33.06 
 
 		 163 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0173  putative tuberculin related peptide  31.82 
 
 		 151 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4393  hypothetical protein  31.46 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.343067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  33 
 
 		 505 aa  42  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>