41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0163 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0163  protein of unknown function DUF1089  100 
 
 		 207 aa  404  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13787  hypothetical protein  38.3 
 
 		 199 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4963  hypothetical protein  39.79 
 
 		 200 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.601635  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5344  hypothetical protein  39.79 
 
 		 200 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.116261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5051  hypothetical protein  39.79 
 
 		 200 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.622775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5597  hypothetical protein  41.58 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0307  protein of unknown function DUF1089  39.79 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1211  hypothetical protein  37.17 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4051  protein of unknown function DUF1089  35.79 
 
 		 192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0524  protein of unknown function DUF1089  33.5 
 
 		 194 aa  104  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0317  protein of unknown function DUF1089  32 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103976  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2652  hypothetical protein  33.61 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2999  hypothetical protein  40.18 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0025  hypothetical protein  29.77 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4603  protein of unknown function DUF1089  35.76 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3333  hypothetical protein  28.97 
 
 		 190 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0237179  normal  0.179396 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4875  protein of unknown function DUF1089  30.51 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000355198  normal  0.582407 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3366  hypothetical protein  31.93 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000501118  hitchhiker  0.0000000000000170165 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3300  hypothetical protein  30.69 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1141  hypothetical protein  31.62 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.167433 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1793  hypothetical protein  30 
 
 		 184 aa  48.5  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0982203  hitchhiker  0.0000201517 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5622  hypothetical protein  33.05 
 
 		 184 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4571  hypothetical protein  28.9 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4013  hypothetical protein  28.11 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4353  hypothetical protein  28.11 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605734  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4530  hypothetical protein  32.2 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.16706 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4072  hypothetical protein  32.2 
 
 		 184 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1333  hypothetical protein  36.89 
 
 		 277 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.349732  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1188  hypothetical protein  23.66 
 
 		 189 aa  45.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0444931  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2515  hypothetical protein  35.64 
 
 		 410 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0294  hypothetical protein  35.64 
 
 		 279 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0164483  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4123  protein of unknown function DUF1089  23.23 
 
 		 182 aa  45.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4015  hypothetical protein  33.9 
 
 		 185 aa  45.1  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.700649 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1312  hypothetical protein  35.64 
 
 		 185 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38720  hypothetical protein  28.44 
 
 		 187 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0568  hypothetical protein  35.64 
 
 		 182 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4678  hypothetical protein  31.36 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376007  normal  0.194539 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1260  hypothetical protein  35.64 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.928683  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3690  hypothetical protein  31.36 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1824  protein of unknown function DUF1089  34.23 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00397249  normal  0.0794049 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3511  hypothetical protein  27.57 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>