35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4037 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_4037  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  235  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4033  peptidase M48, Ste24p  92.63 
 
 		 521 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3383  peptidase M48 Ste24p  91.58 
 
 		 521 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  78.69 
 
 		 554 aa  101  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0392  peptidase M48, Ste24p  61.73 
 
 		 525 aa  97.8  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  54.55 
 
 		 548 aa  95.5  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  72.13 
 
 		 541 aa  92  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  53.49 
 
 		 521 aa  81.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  55.74 
 
 		 549 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  53.73 
 
 		 514 aa  77.8  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  49.28 
 
 		 553 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  43.33 
 
 		 533 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  49.15 
 
 		 590 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  42.25 
 
 		 605 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  49.15 
 
 		 562 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  49.12 
 
 		 569 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  47.46 
 
 		 589 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  49.12 
 
 		 572 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  47.46 
 
 		 589 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  49.12 
 
 		 572 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  49.12 
 
 		 572 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  49.12 
 
 		 572 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  47.46 
 
 		 589 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  49.12 
 
 		 560 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  47.37 
 
 		 564 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  47.37 
 
 		 588 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  47.37 
 
 		 588 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  47.37 
 
 		 588 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  51.11 
 
 		 593 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  47.37 
 
 		 564 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  47.37 
 
 		 564 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  43.66 
 
 		 479 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  32.84 
 
 		 569 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  32.84 
 
 		 567 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  38.18 
 
 		 561 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>