17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2447 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2447  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  749    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.938237 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1658  hypothetical protein  41.23 
 
 
305 aa  249  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0109  hypothetical protein  52.51 
 
 
305 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2494  hypothetical protein  54.11 
 
 
333 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1619  hypothetical protein  47.15 
 
 
314 aa  237  3e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.175531  normal  0.0226832 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2357  hypothetical protein  53.95 
 
 
302 aa  236  6e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0335886  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4744  hypothetical protein  52.38 
 
 
304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111943  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0867  hypothetical protein  52.4 
 
 
303 aa  227  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0890858  normal  0.747224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1182  hypothetical protein  50.47 
 
 
298 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.6386  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2728  hypothetical protein  49.32 
 
 
304 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0756893  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3686  hypothetical protein  52.09 
 
 
310 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439169  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0203  hypothetical protein  49.78 
 
 
316 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5360  hypothetical protein  36.91 
 
 
344 aa  106  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0641445 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4314  hypothetical protein  31.56 
 
 
427 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5090  hypothetical protein  30.95 
 
 
423 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.948231  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5048  hypothetical protein  27.35 
 
 
337 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0131682  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1538  hypothetical protein  26.46 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.292569  normal  0.943893 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>