112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1626 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1626  thioesterase, menaquinone synthesis protein  100 
 
 
278 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.833654  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  34.39 
 
 
265 aa  116  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 
267 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  26.91 
 
 
270 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  26.91 
 
 
270 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 
270 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2049  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 
262 aa  106  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  26.91 
 
 
270 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  26.91 
 
 
270 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  26.91 
 
 
270 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  26.91 
 
 
270 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
270 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  26.91 
 
 
270 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  27.27 
 
 
270 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  32.44 
 
 
269 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0329  thioesterase, menaquinone synthesis protein  28.83 
 
 
301 aa  101  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0291902 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2839  alpha/beta hydrolase fold protein  29.25 
 
 
267 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.39297 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 
280 aa  92.8  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 
277 aa  92.8  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3702  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  28.11 
 
 
274 aa  92.4  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0631  alpha/beta fold family hydrolase  27.57 
 
 
267 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  32.68 
 
 
278 aa  91.3  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0753  alpha/beta fold family hydrolase  27.13 
 
 
266 aa  90.5  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4319  Alpha/beta hydrolase fold  30.67 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2076  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
268 aa  90.1  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.484509 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  31.93 
 
 
271 aa  89.4  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  27.89 
 
 
267 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1128  alpha/beta hydrolase fold  34.85 
 
 
256 aa  88.2  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  27.27 
 
 
270 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  32.56 
 
 
270 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  32.41 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1103  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
267 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1126  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
267 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0193485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4289  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0263366 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0208  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.931775  hitchhiker  0.0000130442 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02190  predicted peptidase  30.17 
 
 
252 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1394  alpha/beta hydrolase fold protein  30.17 
 
 
252 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2409  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  30.17 
 
 
252 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0325408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02149  hypothetical protein  30.17 
 
 
252 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2559  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  30.58 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175086  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1385  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  29.75 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3405  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  29.34 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0367358  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5610  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2642  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  30.58 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0298629  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0177  Fis family transcriptional regulator  27.92 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0225  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4158  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0178  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2813  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  29.1 
 
 
258 aa  72  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3461  alpha/beta fold family hydrolase  28.87 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2548  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  27.27 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.13969  normal  0.758429 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2975  alpha/beta hydrolase fold protein  31.5 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2894  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164031  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2493  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  27.46 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.220295  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2536  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  27.46 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2418  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  28.63 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.081901  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2444  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  26.75 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0199613  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1017  hypothetical protein  31.84 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2652  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  27.46 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00598559  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0772  alpha/beta fold family hydrolase  26.81 
 
 
271 aa  68.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3972  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3574  alpha/beta hydrolase fold protein  32.31 
 
 
244 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130291  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4574  alpha/beta fold family hydrolase  25.47 
 
 
266 aa  60.1  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3768  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 
267 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 
267 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0616  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  24.7 
 
 
252 aa  58.5  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3966  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1046  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  27.6 
 
 
256 aa  58.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0289895  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1483  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  27.56 
 
 
272 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3013  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  27.73 
 
 
263 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3600  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 
265 aa  57  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1590  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  28.02 
 
 
272 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1784  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  27.63 
 
 
272 aa  55.8  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.359602 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1560  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  26.64 
 
 
263 aa  55.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1112  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  26.92 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0165394  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3202  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  26.07 
 
 
266 aa  52.4  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
273 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3282  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  27.03 
 
 
255 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2496  alpha/beta hydrolase fold protein  33.83 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 
272 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
275 aa  49.7  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0351  alpha/beta hydrolase fold  22.73 
 
 
265 aa  49.7  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5227  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 
233 aa  48.9  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.968895  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0281  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  26.14 
 
 
296 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  29.44 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
296 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  31.49 
 
 
264 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 
284 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5500  putative prolyl aminopeptidase  28.57 
 
 
291 aa  46.2  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0980519  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1100  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  22.14 
 
 
264 aa  46.2  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0235  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  31.87 
 
 
287 aa  45.8  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3833  alpha/beta hydrolase fold protein  25.26 
 
 
302 aa  45.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.549204 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 
295 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.497712 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>