More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0944 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0944  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
378 aa  741    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1231  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.96 
 
 
369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.579512  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1224  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.96 
 
 
369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.736515  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.17 
 
 
376 aa  326  5e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.37 
 
 
365 aa  319  5e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.53 
 
 
372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.86 
 
 
370 aa  311  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.33 
 
 
371 aa  311  1e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.22 
 
 
372 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.31 
 
 
382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0983  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.11 
 
 
381 aa  309  5.9999999999999995e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.410572 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0399  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.75 
 
 
375 aa  308  8e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07170  tRNA-guanine transglycosylase  45.04 
 
 
382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.934048 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.45 
 
 
370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.66 
 
 
373 aa  306  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.64 
 
 
379 aa  306  3e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.64 
 
 
379 aa  306  3e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.05 
 
 
379 aa  306  3e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.38 
 
 
392 aa  306  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.11 
 
 
375 aa  305  6e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1172  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.45 
 
 
372 aa  306  6e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.87 
 
 
394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.2 
 
 
371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.63 
 
 
374 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2520  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.63 
 
 
376 aa  303  4.0000000000000003e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783169  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1114  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.79 
 
 
373 aa  301  9e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.34463  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0144  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.11 
 
 
384 aa  301  9e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0518824  decreased coverage  0.000581764 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3296  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.74 
 
 
383 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300958  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0330  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.7 
 
 
388 aa  301  1e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00349082 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.72 
 
 
367 aa  300  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3270  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.47 
 
 
379 aa  300  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756074  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.41 
 
 
379 aa  300  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.69 
 
 
355 aa  300  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2394  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.89 
 
 
367 aa  300  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.311868  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.51 
 
 
373 aa  300  4e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3071  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.45 
 
 
383 aa  299  5e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.5 
 
 
369 aa  299  5e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2476  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.94 
 
 
383 aa  299  6e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.61 
 
 
370 aa  299  6e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12610  tRNA-guanine transglycosylase  44.56 
 
 
382 aa  298  8e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.63 
 
 
370 aa  298  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1495  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.26 
 
 
376 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.19 
 
 
370 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1410  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.27 
 
 
362 aa  298  1e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2402  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.41 
 
 
726 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.96 
 
 
386 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1267  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.5 
 
 
373 aa  297  2e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.57 
 
 
380 aa  297  3e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2804  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.98 
 
 
376 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1333  queuine tRNA-ribosyltransferase  40 
 
 
370 aa  296  4e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.299331  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.97 
 
 
370 aa  296  4e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1156  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.37 
 
 
388 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10772  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2876  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.16 
 
 
377 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.57 
 
 
372 aa  295  7e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.23 
 
 
374 aa  295  8e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.23 
 
 
373 aa  295  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.51 
 
 
379 aa  293  2e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.44 
 
 
380 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.3 
 
 
371 aa  293  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.13 
 
 
377 aa  294  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2997  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.53 
 
 
384 aa  294  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.39 
 
 
374 aa  293  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  0.0000118913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.39 
 
 
374 aa  293  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000328041  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.14 
 
 
395 aa  293  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.39 
 
 
374 aa  293  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000652098  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.69 
 
 
369 aa  293  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1771  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.97 
 
 
377 aa  293  3e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.27 
 
 
357 aa  293  4e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3407  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.41 
 
 
370 aa  293  4e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.38542  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.17 
 
 
373 aa  293  4e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1470  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.74 
 
 
377 aa  293  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.85 
 
 
392 aa  293  5e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.33 
 
 
377 aa  292  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.293358  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.85 
 
 
392 aa  293  5e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1215  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.17 
 
 
385 aa  293  5e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.557932 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.27 
 
 
382 aa  292  6e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3555  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.35 
 
 
378 aa  291  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1795  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.6 
 
 
377 aa  291  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.0000838007  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.79 
 
 
392 aa  291  1e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.87 
 
 
373 aa  291  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1401  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.3 
 
 
377 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000397481  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2655  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.5 
 
 
378 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  41.6 
 
 
371 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0980  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.16 
 
 
374 aa  291  1e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0093  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.98 
 
 
376 aa  291  1e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0899534  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2807  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.02 
 
 
374 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1321  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.91 
 
 
391 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.42 
 
 
380 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1413  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.02 
 
 
371 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.786795  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.43 
 
 
374 aa  290  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0863  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.22 
 
 
377 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1570  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.02 
 
 
374 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000109087  hitchhiker  0.000000108069 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2882  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.02 
 
 
374 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000363226  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2787  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.02 
 
 
374 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000135544  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.02 
 
 
374 aa  290  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000574895  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0770  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.82 
 
 
376 aa  290  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.196276 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2702  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.39 
 
 
374 aa  291  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000654614  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1432  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.27 
 
 
388 aa  290  2e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0681966  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.98 
 
 
407 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4621  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.61 
 
 
377 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.559921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>