36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0258 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0258  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  473  1e-133  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.345068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0006  hypothetical protein  44.98 
 
 
243 aa  169  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4254  hypothetical protein  43.35 
 
 
243 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3402  hypothetical protein  41.02 
 
 
251 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1835  hypothetical protein  38.11 
 
 
249 aa  143  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.15794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1692  hypothetical protein  40.28 
 
 
247 aa  143  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1171  hypothetical protein  40.17 
 
 
239 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19810  Phosphatidylinositol 3- and 4-kinase  38.22 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827265 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2139  hypothetical protein  37.84 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2665  hypothetical protein  38.84 
 
 
251 aa  131  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.555445  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2778  hypothetical protein  39.44 
 
 
272 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000110826  hitchhiker  0.0000594492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4893  hypothetical protein  39.82 
 
 
259 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379402  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2758  hypothetical protein  39.91 
 
 
250 aa  121  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151836  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2643  phosphatidylinositol 3- and 4-kinase  36.93 
 
 
259 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.654173  normal  0.264962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2167  hypothetical protein  37.86 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1934  hypothetical protein  36.33 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.019437  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3451  hypothetical protein  37.79 
 
 
267 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00447227  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12163  hypothetical protein  35.14 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.822562  normal  0.390759 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16030  hypothetical protein  35.86 
 
 
260 aa  116  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2441  hypothetical protein  33.45 
 
 
281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3480  phosphatidylinositol 3- and 4-kinase, catalytic  32.95 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.244683  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0994  hypothetical protein  37.5 
 
 
247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1953  hypothetical protein  35.97 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5932  hypothetical protein  35.39 
 
 
253 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0174628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2627  hypothetical protein  36.65 
 
 
257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3217  phosphatidylinositol 3- and 4-kinase, catalytic  33.6 
 
 
260 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3155  phosphatidylinositol 3- and 4-kinase, catalytic  33.6 
 
 
260 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0715316  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3167  phosphatidylinositol 3- and 4-kinase, catalytic  33.2 
 
 
260 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3046  phosphatidylinositol 3- and 4-kinase, catalytic  33.07 
 
 
270 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.889585 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2321  hypothetical protein  37.05 
 
 
279 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2103  hypothetical protein  34.82 
 
 
254 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000498307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5401  hypothetical protein  34.1 
 
 
287 aa  106  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295531  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2285  hypothetical protein  33.21 
 
 
265 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1835  hypothetical protein  38.72 
 
 
244 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.675451  normal  0.507868 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0110  hypothetical protein  34.94 
 
 
262 aa  102  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.680927  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26360  Phosphatidylinositol 3- and 4-kinase  33.07 
 
 
255 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.0373097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>