More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0008 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0008  type II secretion system protein E  100 
 
 		 500 aa  1008    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.105652  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1541  type II secretion system protein E  34.02 
 
 		 437 aa  103  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  31.31 
 
 		 412 aa  103  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  34.12 
 
 		 463 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1306  secretion ATPase protein  30.47 
 
 		 433 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.074017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  32.02 
 
 		 500 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  32.02 
 
 		 491 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3134  type II secretion system protein E  32.21 
 
 		 448 aa  100  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  31.58 
 
 		 491 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  31.42 
 
 		 451 aa  99.8  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  33.5 
 
 		 465 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8203  type II secretion system protein E  31.23 
 
 		 442 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  32.13 
 
 		 477 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4142  type II secretion system protein E  29.85 
 
 		 433 aa  98.2  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.965239  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  30.77 
 
 		 482 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6894  type II secretion system protein E  31.09 
 
 		 456 aa  97.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  0.261067 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  34.65 
 
 		 444 aa  97.1  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  35.84 
 
 		 463 aa  97.1  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  29.86 
 
 		 483 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  31.53 
 
 		 476 aa  95.9  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  30.32 
 
 		 488 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  29.86 
 
 		 488 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  30.33 
 
 		 489 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  31.58 
 
 		 445 aa  95.5  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  30.81 
 
 		 490 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  31.42 
 
 		 482 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  31.28 
 
 		 433 aa  95.1  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  30.77 
 
 		 482 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  33.33 
 
 		 441 aa  94.7  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4644  type II secretion system protein E  30.93 
 
 		 452 aa  94  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  30.33 
 
 		 467 aa  94  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  31.78 
 
 		 411 aa  94  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  30.32 
 
 		 482 aa  94  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  32.32 
 
 		 449 aa  93.6  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0628  type II secretion system protein E  30.63 
 
 		 521 aa  93.6  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  30.77 
 
 		 485 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  30.33 
 
 		 485 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  29.86 
 
 		 484 aa  93.2  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  29.86 
 
 		 492 aa  92.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  31.78 
 
 		 450 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  31.6 
 
 		 473 aa  92.8  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  30.97 
 
 		 432 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  30.77 
 
 		 480 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  31.31 
 
 		 452 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  31.63 
 
 		 445 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  32.54 
 
 		 491 aa  91.3  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  36.56 
 
 		 408 aa  91.3  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  31.98 
 
 		 498 aa  91.3  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  29.86 
 
 		 508 aa  91.3  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4031  type II secretion system protein E  30.56 
 
 		 442 aa  90.9  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148527  hitchhiker  0.00766622 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20420  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  31.82 
 
 		 408 aa  90.5  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.441197  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  28.7 
 
 		 479 aa  90.5  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  32.42 
 
 		 454 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  29.14 
 
 		 455 aa  90.1  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  32.42 
 
 		 454 aa  90.1  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  32.42 
 
 		 454 aa  90.1  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  29.85 
 
 		 452 aa  90.1  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  26.29 
 
 		 455 aa  89.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  30.95 
 
 		 472 aa  89.4  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  28.57 
 
 		 462 aa  89.4  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  28.83 
 
 		 455 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  29.82 
 
 		 504 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  31.28 
 
 		 472 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  28.83 
 
 		 455 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  31.6 
 
 		 453 aa  89.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2274  putative secretory protein  35.5 
 
 		 446 aa  88.6  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414077  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  33.92 
 
 		 515 aa  89  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  32.67 
 
 		 428 aa  89.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  32.67 
 
 		 428 aa  89.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  31.94 
 
 		 416 aa  89  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  31.56 
 
 		 467 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  32.67 
 
 		 428 aa  89.4  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  28.78 
 
 		 404 aa  89  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2567  type II secretion system protein E  33.5 
 
 		 469 aa  88.2  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  26.73 
 
 		 459 aa  88.2  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  33.92 
 
 		 523 aa  88.6  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  33.92 
 
 		 521 aa  88.6  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  33.92 
 
 		 523 aa  88.6  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  33.92 
 
 		 520 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  33.88 
 
 		 471 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  37.66 
 
 		 468 aa  88.2  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  32.56 
 
 		 455 aa  88.6  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  33.92 
 
 		 520 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  34.24 
 
 		 440 aa  88.2  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  33.92 
 
 		 520 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  28.12 
 
 		 455 aa  87.8  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  30.66 
 
 		 464 aa  87.8  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  25.78 
 
 		 456 aa  87.8  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  32.56 
 
 		 455 aa  87.8  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  30.32 
 
 		 482 aa  87.8  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0554  type II secretion system protein E  33.14 
 
 		 439 aa  87.4  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  31.36 
 
 		 492 aa  87.8  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  29.55 
 
 		 449 aa  87.4  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  37.01 
 
 		 608 aa  87  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  33.93 
 
 		 624 aa  87  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2224  type II secretion system protein E  31.55 
 
 		 386 aa  87  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8746  type II secretion system protein E  37.43 
 
 		 692 aa  86.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.400564 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1033  type II secretion system protein E  29.8 
 
 		 418 aa  86.7  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  30.18 
 
 		 521 aa  86.7  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  33.93 
 
 		 560 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>