60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3955 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3955  CheW protein  100 
 
 		 182 aa  332  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4098  CheW protein  92.05 
 
 		 188 aa  271  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000019346  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4065  CheW protein  91.91 
 
 		 190 aa  263  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0465  putative CheW protein  58.72 
 
 		 191 aa  180  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0376548  normal  0.568555 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3537  putative CheW protein  38.85 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0254908 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  34.09 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  33.33 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  33.62 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.76 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  32.76 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  33.62 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  32.76 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  32.76 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  33.33 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  33.62 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  29.55 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  33.62 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  32.81 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0066  CheW protein  50.85 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  32.58 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  30.47 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  33.59 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.59 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  33.59 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  32.58 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  33.59 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  33.59 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  33.59 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  33.59 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  33.59 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.59 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  33.59 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  32.86 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  30.28 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  40.23 
 
 		 164 aa  52.4  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  30.3 
 
 		 161 aa  52  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.37 
 
 		 174 aa  51.2  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  31.06 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  28.37 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  31.48 
 
 		 163 aa  48.9  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  28.37 
 
 		 164 aa  47.8  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  28.37 
 
 		 164 aa  47.8  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  32.77 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  32.18 
 
 		 779 aa  45.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  20.34 
 
 		 146 aa  45.4  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  32 
 
 		 159 aa  44.7  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0761  CheW protein  36.84 
 
 		 475 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.951826  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0224  CheW protein  31.43 
 
 		 131 aa  43.9  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.492147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16440  hypothetical protein  35.71 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  26.72 
 
 		 331 aa  43.5  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2069  CheW protein  35.71 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101328 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1464  CheW protein  28.42 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1438  CheW protein  28.42 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  28.95 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0828  CheW domain-containing protein  37.04 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.196204  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01609  hypothetical protein  34.57 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2293  putative CheW protein  35.04 
 
 		 150 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  35.05 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  32.11 
 
 		 162 aa  41.2  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0498  putative chemotaxis protein, CheW-like  24.63 
 
 		 302 aa  40.8  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.857231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>