18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3553 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3553  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  570  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0282  hypothetical protein  34.96 
 
 
279 aa  138  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2921  hypothetical protein  30.92 
 
 
274 aa  123  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  24.71 
 
 
379 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  25.57 
 
 
379 aa  59.3  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  25.67 
 
 
379 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  26.79 
 
 
387 aa  53.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2029  hypothetical protein  25.17 
 
 
141 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  27.17 
 
 
387 aa  52.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  27.17 
 
 
387 aa  52.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  27.17 
 
 
387 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  27.17 
 
 
387 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  27.17 
 
 
387 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  27.34 
 
 
387 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  30.12 
 
 
1048 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2030  hypothetical protein  25.23 
 
 
105 aa  46.6  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.94086 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3266  DNA-dependent ATPase I and helicase II  30.14 
 
 
1041 aa  42.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.951374  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  24.91 
 
 
1052 aa  42.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.101502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>