27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2770 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2770  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 460 aa  882    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1490  polysaccharide biosynthesis protein  39.14 
 
 		 479 aa  276  8e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2629  polysaccharide biosynthesis protein  34.29 
 
 		 474 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  21.5 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1015  EPS I polysaccharide export inner membrane transmembrane protein  25.3 
 
 		 436 aa  67  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.292818  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  24.09 
 
 		 453 aa  66.6  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  25.2 
 
 		 488 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  24.34 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  24.17 
 
 		 482 aa  56.6  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  20.15 
 
 		 446 aa  55.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  27.63 
 
 		 495 aa  54.3  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09393  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.27 
 
 		 428 aa  53.1  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.512575  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0890  polysaccharide biosynthesis protein  26.55 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  26.17 
 
 		 512 aa  50.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  25.69 
 
 		 444 aa  50.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  20.3 
 
 		 479 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  28.64 
 
 		 451 aa  48.9  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 		 509 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  18.87 
 
 		 482 aa  47  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  27.02 
 
 		 441 aa  46.6  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  21.31 
 
 		 435 aa  47  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  25.14 
 
 		 514 aa  46.6  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  23.5 
 
 		 495 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3971  polysaccharide biosynthesis protein  31.06 
 
 		 582 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  24.05 
 
 		 448 aa  44.3  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  21.5 
 
 		 479 aa  43.9  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 		 503 aa  43.1  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>