32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2148 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2148  outer membrane lipoprotein, putative  100 
 
 
182 aa  362  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.433654  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1733  outer membrane lipoprotein, putative  97.55 
 
 
163 aa  241  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00359299  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1806  outer membrane lipoprotein, putative  96.93 
 
 
163 aa  239  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.29621  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1670  outer membrane lipoprotein, putative  58.39 
 
 
159 aa  95.5  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.301907  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  31.21 
 
 
272 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 
206 aa  48.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  35.25 
 
 
165 aa  47.8  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  28.93 
 
 
208 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  35.83 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  29.13 
 
 
218 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  29.13 
 
 
218 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  29.13 
 
 
218 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  29.13 
 
 
218 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  29.13 
 
 
218 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  29.13 
 
 
218 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  29.13 
 
 
218 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  31.15 
 
 
204 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  35.11 
 
 
225 aa  46.2  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  32.35 
 
 
216 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  31.62 
 
 
216 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  31.16 
 
 
215 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  31.16 
 
 
215 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1151  17 kDa surface antigen  33.73 
 
 
154 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.965272  normal  0.0962172 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  29.05 
 
 
155 aa  44.7  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4284  17 kDa surface antigen  29.59 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1131  17 kDa surface antigen  29.59 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40399  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  29.19 
 
 
155 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2871  17 kDa surface antigen-like protein  31.76 
 
 
155 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000441534  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2695  17 kDa surface antigen  32.23 
 
 
160 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000023242  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1167  17 kDa surface antigen  28.99 
 
 
154 aa  42  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  27.5 
 
 
164 aa  41.6  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536943  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2656  17 kDa surface antigen  33.06 
 
 
173 aa  41.6  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128557  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>