130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1756 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1756  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  100 
 
 
453 aa  884    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2178  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  96.91 
 
 
453 aa  822    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2084  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  95.36 
 
 
453 aa  810    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0351  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  62.69 
 
 
437 aa  528  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0488  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  62.69 
 
 
437 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0421  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  62.91 
 
 
437 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0364  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  62.69 
 
 
437 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0354  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  62.69 
 
 
437 aa  526  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0378  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  62.69 
 
 
437 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0366  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  62.91 
 
 
437 aa  525  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0441  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  62.69 
 
 
437 aa  527  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0359  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  62.91 
 
 
437 aa  527  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4883  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  62.91 
 
 
437 aa  525  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0489  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  62.47 
 
 
437 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1605  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  60.62 
 
 
441 aa  520  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2657  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  57.59 
 
 
433 aa  487  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000544517  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0240  hypothetical protein  49.23 
 
 
439 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3278  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  54.02 
 
 
443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.737723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3845  anaerobic c4-dicarboxylate membrane transporter family protein  53.63 
 
 
441 aa  436  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1227  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  53.69 
 
 
437 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0182987  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3974  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  48.66 
 
 
439 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1023  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.56 
 
 
442 aa  396  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3913  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  48.66 
 
 
439 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.689386  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3793  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  48.66 
 
 
439 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261131  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3805  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  48.66 
 
 
439 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3871  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  48.44 
 
 
439 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0593006  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0158  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  52.57 
 
 
436 aa  385  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000075  C4-dicarboxylate like transporter  44.87 
 
 
443 aa  388  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.834607  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05690  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.64 
 
 
443 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2007  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  45.45 
 
 
433 aa  384  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2500  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.41 
 
 
447 aa  381  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4417  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.54 
 
 
447 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1566  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.77 
 
 
441 aa  370  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3893  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family protein  44.37 
 
 
433 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0302  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.44 
 
 
447 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2479  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.95 
 
 
447 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0298  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.44 
 
 
447 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0307  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.44 
 
 
447 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0303  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.44 
 
 
447 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0293  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.88 
 
 
447 aa  365  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000012855 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0293  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.88 
 
 
447 aa  364  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000600202 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3540  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.8 
 
 
442 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000247021  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3726  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.65 
 
 
447 aa  362  9e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4182  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.79 
 
 
441 aa  361  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.877677 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1304  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  47.14 
 
 
443 aa  360  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000133068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3993  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.35 
 
 
440 aa  361  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000171498  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0685  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.33 
 
 
438 aa  360  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1800  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.47 
 
 
447 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.920741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1726  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.69 
 
 
447 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3841  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.64 
 
 
438 aa  359  7e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2751  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.47 
 
 
442 aa  355  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2921  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  47.25 
 
 
443 aa  354  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3222  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.89 
 
 
447 aa  353  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2120  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.37 
 
 
441 aa  351  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.20125  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3359  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.67 
 
 
447 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3748  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  43.79 
 
 
433 aa  345  7e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0617  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  43.79 
 
 
433 aa  345  7e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0639  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  43.79 
 
 
433 aa  345  7e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0681  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family protein  43.53 
 
 
415 aa  341  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0588  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.64 
 
 
435 aa  341  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0683  anaerobic c4-dicarboxylate transporter DcuB  44.81 
 
 
444 aa  335  7e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.788285  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3408  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.16 
 
 
433 aa  332  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1121  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.03 
 
 
438 aa  331  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0644  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  43.41 
 
 
415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3533  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.46 
 
 
433 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0325  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.18 
 
 
433 aa  325  9e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000434648 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0561  C4-dicarboxylate transporter, anaerobic  41.27 
 
 
442 aa  322  9.000000000000001e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3854  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  42.17 
 
 
433 aa  320  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0505  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.95 
 
 
433 aa  320  3e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04008  C4-dicarboxylate antiporter  41.96 
 
 
433 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5654  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.96 
 
 
433 aa  318  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00371648  normal  0.384394 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1912  hypothetical protein  41.2 
 
 
446 aa  318  1e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000048049  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4379  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.96 
 
 
433 aa  318  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0860444  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3874  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.96 
 
 
433 aa  318  1e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03970  hypothetical protein  41.96 
 
 
433 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4607  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.96 
 
 
433 aa  318  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.104112  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4667  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.96 
 
 
433 aa  318  1e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.654313  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4693  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.74 
 
 
433 aa  317  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0772  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.86 
 
 
474 aa  316  5e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3679  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.9 
 
 
433 aa  316  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1556  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  37.48 
 
 
497 aa  316  5e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.678975  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0726  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.9 
 
 
433 aa  316  5e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3826  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.9 
 
 
433 aa  316  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00155  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.39 
 
 
435 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4686  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.74 
 
 
433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4743  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.74 
 
 
433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.722845 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4595  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.74 
 
 
433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4603  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.74 
 
 
433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4721  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.74 
 
 
433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0855825  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3576  anaerobic c4-dicarboxylate membrane transporter family protein  42.44 
 
 
446 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0697  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.65 
 
 
474 aa  312  5.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2701  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.56 
 
 
433 aa  312  9e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0405  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.42 
 
 
433 aa  310  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219267  hitchhiker  0.00256647 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0724  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.66 
 
 
433 aa  311  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002213  C4-dicarboxylate transporter anaerobic  43.66 
 
 
435 aa  311  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1644  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  40.94 
 
 
445 aa  310  4e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1406  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.44 
 
 
446 aa  310  4e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4696  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.12 
 
 
446 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1089  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.15 
 
 
432 aa  307  3e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1122  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.87 
 
 
438 aa  307  3e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.253067 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>