172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1533 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1533  protein translocase subunit secG  100 
 
 
122 aa  232  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2422  preprotein translocase, SecG subunit  96.94 
 
 
122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00340269  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2334  preprotein translocase, SecG subunit  96.94 
 
 
122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.346988  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2058  preprotein translocase subunit SecG  45.8 
 
 
134 aa  94.4  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  47.5 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2279  preprotein translocase, SecG subunit  64.66 
 
 
127 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.724804  normal  0.353125 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1627  preprotein translocase subunit SecG  56.63 
 
 
122 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0003761  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1884  protein translocase subunit secG  46.28 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110105  normal  0.520144 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1334  preprotein translocase, SecG subunit  58.33 
 
 
117 aa  85.9  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.6051400000000003e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1619  preprotein translocase subunit SecG  50.49 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000330295  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1902  protein translocase subunit secG  55.26 
 
 
99 aa  84.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254775 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  38.39 
 
 
111 aa  84.3  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2339  preprotein translocase subunit SecG  45.54 
 
 
132 aa  83.6  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000342289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1696  preprotein translocase subunit SecG  58.33 
 
 
117 aa  83.6  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000318284  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1881  preprotein translocase subunit SecG  44.14 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0071  preprotein translocase subunit SecG  46.81 
 
 
102 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.293061 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0498  preprotein translocase, SecG subunit  51.75 
 
 
111 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  44.68 
 
 
106 aa  79  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0066  preprotein translocase subunit SecG  45.74 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  36.13 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  42.61 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  42.61 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0153  preprotein translocase subunit SecG  42.86 
 
 
105 aa  73.9  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2716  protein translocase subunit secG  34.21 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110807  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62810  preprotein translocase subunit SecG  43.21 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5467  preprotein translocase subunit SecG  36.52 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2058  preprotein translocase, SecG subunit  50 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.753459  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  50 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01686  protein-export membrane protein secG(General Secretory Pathway)  37.61 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010921  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42850  preprotein translocase subunit SecG  36.61 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4493  preprotein translocase, SecG subunit  37.27 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.23755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4183  preprotein translocase subunit SecG  36.89 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0776  preprotein translocase subunit SecG  35 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000389884  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3611  preprotein translocase subunit SecG  44.44 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0985  preprotein translocase, SecG subunit  41.58 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460003  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1620  preprotein translocase, SecG subunit  46.05 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0438601  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  32.46 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0543  protein translocase subunit  46.05 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2837  preprotein translocase subunit SecG  36.11 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2706  preprotein translocase subunit SecG  36.11 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1024  preprotein translocase, SecG subunit  53.09 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00245496  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1548  preprotein translocase, SecG subunit  39.29 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.651652  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1741  preprotein translocase subunit SecG  43.42 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1965  preprotein translocase, SecG subunit  50 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00004377  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  35 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3447  preprotein translocase, SecG subunit  35.54 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  33.05 
 
 
110 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  33.05 
 
 
110 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  33.05 
 
 
110 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  33.05 
 
 
110 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  33.05 
 
 
110 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  45.71 
 
 
128 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3471  preprotein translocase subunit SecG  31.36 
 
 
110 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  31.67 
 
 
111 aa  60.8  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0532  preprotein translocase, SecG subunit  35.65 
 
 
110 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.598556  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3595  preprotein translocase subunit SecG  35.65 
 
 
110 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0141427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4497  preprotein translocase subunit SecG  35.65 
 
 
110 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0118643  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  45.71 
 
 
125 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1971  preprotein translocase subunit SecG  39.66 
 
 
118 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0250933 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3349  preprotein translocase, SecG subunit  32.77 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0169  preprotein translocase subunit SecG  41.43 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000528486  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  34.17 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03040  protein-export membrane protein  34.15 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339668  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0525  preprotein translocase subunit SecG  34.15 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02991  hypothetical protein  34.15 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3988  preprotein translocase subunit SecG  31.67 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109182  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3599  preprotein translocase subunit SecG  31.67 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162935  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3367  preprotein translocase subunit SecG  34.15 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3660  preprotein translocase subunit SecG  34.15 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000383987  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3468  preprotein translocase, SecG subunit  34.55 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3733  preprotein translocase subunit SecG  34.55 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0213713  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1402  protein translocase subunit secG  38.2 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0700818  normal  0.793248 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1052  preprotein translocase, SecG subunit  37.84 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4715  preprotein translocase subunit SecG  46.05 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2830  preprotein translocase subunit SecG  35.04 
 
 
114 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000815505  hitchhiker  0.00315875 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4580  preprotein translocase subunit SecG  46.05 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.452922  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0718  preprotein translocase subunit SecG  46.05 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.106804 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1027  preprotein translocase subunit SecG  42.86 
 
 
125 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000322315  normal  0.29727 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1766  preprotein translocase subunit SecG  34.11 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03401  preprotein translocase subunit SecG  35.44 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2274  preprotein translocase subunit SecG  42.86 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000142621  normal  0.0890733 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1638  preprotein translocase subunit SecG  42.86 
 
 
125 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000164362  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2010  preprotein translocase subunit SecG  42.86 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000141449  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2288  preprotein translocase subunit SecG  44.16 
 
 
125 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000673415  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2250  preprotein translocase subunit SecG  42.86 
 
 
125 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000247894  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0595  preprotein translocase subunit SecG  36.71 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.680652  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2167  preprotein translocase subunit SecG  44.16 
 
 
125 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000804572  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002606  preprotein translocase subunit SecG  33.96 
 
 
112 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000104181  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5578  preprotein translocase subunit SecG  42.86 
 
 
125 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233541  normal  0.139933 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1831  preprotein translocase subunit SecG  42.11 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.691878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1433  preprotein translocase subunit SecG  42.11 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1311  preprotein translocase subunit SecG  40.26 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.199166  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  41.43 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1128  preprotein translocase subunit SecG  42.11 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.20608  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0739  preprotein translocase subunit SecG  42.11 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0201173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1288  preprotein translocase subunit SecG  42.11 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1297  preprotein translocase subunit SecG  42.11 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0411  preprotein translocase subunit SecG  42.11 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.59525  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1059  preprotein translocase subunit SecG  42.11 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000688057  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0987  preprotein translocase subunit SecG  33.62 
 
 
111 aa  53.9  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000357257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>