166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1863 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1863  ribulose bisphosphate carboxylase, type III  100 
 
 		 421 aa  855    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1084  ribulose bisphosphate carboxylase, type III  55.45 
 
 		 420 aa  463  1e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.518346  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0902  ribulose bisophosphate carboxylase  50.24 
 
 		 428 aa  432  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1325  ribulose bisophosphate carboxylase  48.69 
 
 		 430 aa  403  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1105  ribulose bisophosphate carboxylase  49.06 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1616  ribulose-bisphosphate carboxylase  47.77 
 
 		 390 aa  359  6e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.43252  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0732  ribulose bisphosphate carboxylase, type III  45.88 
 
 		 418 aa  355  6.999999999999999e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1227  ribulose bisophosphate carboxylase  47.69 
 
 		 443 aa  343  4e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0258  Ribulose-bisphosphate carboxylase  43.66 
 
 		 399 aa  335  1e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2766  ribulose bisophosphate carboxylase  46.4 
 
 		 423 aa  334  2e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0553432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0558  ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit  44.15 
 
 		 403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0297277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1655  Ribulose-bisphosphate carboxylase  44.39 
 
 		 482 aa  325  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.471875  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2315  ribulose-bisphosphate carboxylase  41.71 
 
 		 399 aa  323  4e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1426  ribulose bisophosphate carboxylase  46.06 
 
 		 472 aa  320  3.9999999999999996e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3203  ribulose bisophosphate carboxylase  45.91 
 
 		 473 aa  319  6e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0752569  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0858  Ribulose-bisphosphate carboxylase  46.17 
 
 		 473 aa  318  9e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1747  ribulose bisophosphate carboxylase  45.07 
 
 		 485 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1195  ribulose bisophosphate carboxylase  43.21 
 
 		 484 aa  317  3e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0459854 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0752  ribulose bisophosphate carboxylase  45.67 
 
 		 471 aa  315  9e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.538188  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2929  ribulose bisophosphate carboxylase  45.34 
 
 		 489 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.880284  normal  0.859268 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2712  ribulose bisophosphate carboxylase  42.66 
 
 		 486 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6397  ribulose bisophosphate carboxylase  45.07 
 
 		 486 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4049  ribulose bisophosphate carboxylase  45.34 
 
 		 488 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.542382  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2624  ribulose bisophosphate carboxylase  46.67 
 
 		 473 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1614  ribulose bisophosphate carboxylase  46.68 
 
 		 470 aa  311  1e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.036297  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3964  ribulose bisophosphate carboxylase  44.58 
 
 		 485 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.909404  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1046  ribulose bisophosphate carboxylase  46.83 
 
 		 473 aa  311  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00838845  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0451  ribulose bisophosphate carboxylase  44.58 
 
 		 488 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411359 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3722  ribulose bisophosphate carboxylase  44.58 
 
 		 485 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0880816  hitchhiker  0.00193394 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4332  ribulose bisophosphate carboxylase  44.88 
 
 		 473 aa  311  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1699  ribulose bisophosphate carboxylase  42.43 
 
 		 487 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2782  ribulose bisophosphate carboxylase  44.5 
 
 		 521 aa  311  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0119  ribulose bisophosphate carboxylase  45.07 
 
 		 473 aa  310  4e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.254906  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0922  ribulose bisophosphate carboxylase  46.53 
 
 		 473 aa  310  4e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3924  ribulose bisophosphate carboxylase  42.2 
 
 		 486 aa  309  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3751  ribulose bisophosphate carboxylase  45.1 
 
 		 488 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3907  ribulose bisophosphate carboxylase  45.1 
 
 		 476 aa  308  8e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1987  ribulose bisophosphate carboxylase  44.99 
 
 		 473 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1327  ribulose bisophosphate carboxylase  44.33 
 
 		 523 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.180974  normal  0.453958 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2743  ribulose bisophosphate carboxylase  45.85 
 
 		 473 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2641  ribulose bisophosphate carboxylase  45.09 
 
 		 479 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08081  ribulose bisophosphate carboxylase  46.93 
 
 		 470 aa  306  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1282  ribulose bisophosphate carboxylase  42.43 
 
 		 486 aa  306  6e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2660  ribulose bisophosphate carboxylase  45.52 
 
 		 473 aa  306  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2941  ribulose bisophosphate carboxylase  42.43 
 
 		 486 aa  306  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3051  ribulose bisophosphate carboxylase  45.52 
 
 		 473 aa  306  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1879  ribulose bisophosphate carboxylase  46.68 
 
 		 470 aa  305  9.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06041  ribulose bisophosphate carboxylase  46.68 
 
 		 470 aa  305  9.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.337887 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3422  ribulose bisophosphate carboxylase  44.61 
 
 		 476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.804986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1549  ribulose bisophosphate carboxylase  45.82 
 
 		 472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05521  ribulose bisophosphate carboxylase  46.8 
 
 		 470 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3255  Ribulose-bisphosphate carboxylase  44.9 
 
 		 480 aa  304  3.0000000000000004e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.936346  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0550  ribulose bisophosphate carboxylase  46.55 
 
 		 471 aa  303  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06061  ribulose bisophosphate carboxylase  46.55 
 
 		 471 aa  303  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.142488  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06141  ribulose bisophosphate carboxylase  46.55 
 
 		 471 aa  303  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1501  ribulose bisophosphate carboxylase  44.65 
 
 		 473 aa  302  7.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0011462  normal  0.0288871 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05761  ribulose bisophosphate carboxylase  46.55 
 
 		 471 aa  302  7.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0310846  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0824  ribulose bisophosphate carboxylase  42.21 
 
 		 493 aa  302  8.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0838  ribulose bisophosphate carboxylase  45.52 
 
 		 471 aa  301  1e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1367  ribulose bisophosphate carboxylase  44.33 
 
 		 472 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1602  ribulose bisophosphate carboxylase  44.33 
 
 		 472 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1628  ribulose bisophosphate carboxylase  44.33 
 
 		 472 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2153  ribulose-bisphosphate carboxylase  43.63 
 
 		 476 aa  299  5e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3032  ribulose bisophosphate carboxylase  42.79 
 
 		 488 aa  298  9e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4063  ribulose bisophosphate carboxylase  45.74 
 
 		 473 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.134131 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4410  ribulose bisophosphate carboxylase  43.84 
 
 		 476 aa  297  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0333  ribulose bisophosphate carboxylase  44.74 
 
 		 492 aa  297  3e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0427  ribulose bisophosphate carboxylase  45.68 
 
 		 472 aa  296  3e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1389  ribulose bisophosphate carboxylase  45.93 
 
 		 473 aa  295  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1691  ribulose bisophosphate carboxylase  45.93 
 
 		 473 aa  295  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2836  ribulose bisophosphate carboxylase  44.27 
 
 		 473 aa  292  9e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1918  ribulose bisophosphate carboxylase  42.33 
 
 		 488 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1478  ribulose bisophosphate carboxylase  41.91 
 
 		 488 aa  290  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.263508  normal  0.452968 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6497  ribulose bisophosphate carboxylase  41.37 
 
 		 501 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0522154 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0686  ribulose bisophosphate carboxylase  43.77 
 
 		 489 aa  287  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.153221  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2453  ribulose bisophosphate carboxylase  42.24 
 
 		 499 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.182624 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2322  ribulose bisphosphate carboxylase  37.83 
 
 		 474 aa  253  6e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5642  ribulose-bisphosphate carboxylase  36.49 
 
 		 424 aa  216  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.741434  hitchhiker  0.00245701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1846  ribulose-bisphosphate carboxylase  32.4 
 
 		 425 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0119107 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0013  Ribulose-bisphosphate carboxylase  33.64 
 
 		 428 aa  196  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2138  Ribulose-bisphosphate carboxylase  33.02 
 
 		 420 aa  189  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.763721  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3215  ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit  31.95 
 
 		 429 aa  186  7e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3435  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  31.12 
 
 		 428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133451  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5257  ribulose-bisphosphate carboxylase  32.48 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2924  ribulose-bisphosphate carboxylase  32.31 
 
 		 414 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0462  ribulose-bisphosphate carboxylase  32.88 
 
 		 432 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.105525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1732  ribulose-bisphosphate carboxylase  31.16 
 
 		 423 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3067  ribulose-bisphosphate carboxylase  32.56 
 
 		 418 aa  180  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1745  2,3-diketo-5-methylthiopentyl-1-phosphate enolase  30 
 
 		 413 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0093  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  31.9 
 
 		 413 aa  178  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4020  ribulose bisphosphate carboxylase  31.81 
 
 		 461 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2747  Ribulose-bisphosphate carboxylase  29.68 
 
 		 416 aa  176  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.32552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3271  ribulose bisphosphate carboxylase  31.58 
 
 		 459 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.841857  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1801  Ribulose-bisphosphate carboxylase  32.29 
 
 		 428 aa  176  6e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.48391 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4004  ribulose bisphosphate carboxylase  31.58 
 
 		 459 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.988794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0951  ribulose bisphosphate carboxylase  31.44 
 
 		 461 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2334  Ribulose-bisphosphate carboxylase  31.96 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903327  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0424  ribulose bisphosphate carboxylase  31.35 
 
 		 459 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.657605  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0850  2,3-diketo-5-methylthiopentyl-1-phosphate enolase  30.42 
 
 		 413 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000268657  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1945  Ribulose-bisphosphate carboxylase  33.24 
 
 		 423 aa  175  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>