21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1740 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1054    99.16 
 
 
1087 bp  2040    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.49061  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2086    99.53 
 
 
1071 bp  2077    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1958  Integrase catalytic region  99.63 
 
 
1218 bp  2085    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1954  Integrase catalytic region  99.63 
 
 
1185 bp  2085    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1933  Integrase catalytic region  99.53 
 
 
1161 bp  2077    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0182276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1805  Integrase catalytic region  98.41 
 
 
1302 bp  1982    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1740    100 
 
 
1072 bp  2125    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000115615  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1456  Integrase catalytic region  97.2 
 
 
1185 bp  1879    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1433  Integrase catalytic region  97.57 
 
 
1239 bp  1911    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.331457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1238  Integrase catalytic region  99.44 
 
 
1149 bp  2070    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00285925  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1186  Integrase catalytic region  98.32 
 
 
1233 bp  1974    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0128  Integrase catalytic region  99.53 
 
 
1170 bp  2077    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000825928  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1025  Integrase catalytic region  99.35 
 
 
1281 bp  2062    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0949  Integrase catalytic region  96.79 
 
 
1041 bp  1663    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000104793  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0482  Integrase catalytic region  98.23 
 
 
1152 bp  1966    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.060676  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0459  Integrase catalytic region  98.23 
 
 
1164 bp  1966    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0147669  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0398  Integrase catalytic region  99.44 
 
 
1203 bp  2070    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00305387  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0288    99.63 
 
 
1071 bp  2085    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000630151  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0220    99.63 
 
 
1126 bp  2079    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000183549  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0194  Integrase catalytic region  99.35 
 
 
1155 bp  2062    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0249438  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0428  hypothetical protein  99.16 
 
 
165 bp  228  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000068891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>