More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0054 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0054  response regulator receiver protein  100 
 
 		 109 aa  206  9e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2177  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2784  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0945133  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3334  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0766  two component signal transduction response regulator  37.17 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2406  response regulator receiver domain-containing protein  41.59 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0215  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.23 
 
 		 528 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0571306 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1657  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 459 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000574549  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  36.21 
 
 		 231 aa  67.4  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3857  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 122 aa  66.6  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.161717  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2412  histidine kinase  46.25 
 
 		 603 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.59 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5466  stage 0 sporulation protein F  31.3 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0750811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5185  stage 0 sporulation protein F  31.3 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0413406  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5020  stage 0 sporulation protein F  31.3 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000180816  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5036  stage 0 sporulation protein F  31.3 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000486089  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0790  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.93 
 
 		 466 aa  65.1  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5514  sporulation initiation phosphotransferase F  31.3 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000170867  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5581  stage 0 sporulation protein F  31.3 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5134  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0135031  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5493  sporulation initiation phosphotransferase F  29.57 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000162821  unclonable  2.17721e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5459  sporulation initiation phosphotransferase F  31.3 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000856307  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5429  sporulation initiation phosphotransferase F  31.3 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.26925e-31 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3178  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00591737  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3985  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3444  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  36.13 
 
 		 969 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0607  two component transcriptional regulator  39.62 
 
 		 248 aa  63.9  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3367  DNA-binding transcriptional regulator TorR  37.61 
 
 		 236 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 457 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1985  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.52 
 
 		 650 aa  63.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 309 aa  63.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2803  DNA-binding transcriptional regulator TorR  37.14 
 
 		 241 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0495  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 456 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.38 
 
 		 227 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 278 aa  63.5  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 391 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2719  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3757  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  38.32 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2006  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1886  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.29 
 
 		 461 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  36.21 
 
 		 457 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  40 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2449  response regulator receiver  31.62 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000856797 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0870  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.226165  normal  0.635424 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2551  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2650  response regulator receiver domain-containing protein  32.48 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2110  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1685  two component Fis family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 457 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529377  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.18 
 
 		 977 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4142  response regulator receiver domain-containing protein  36.54 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.996905  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0666  response regulator receiver  40.57 
 
 		 240 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2316  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000147543  hitchhiker  0.000888492 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1488  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  38.1 
 
 		 228 aa  62  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1438  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 118 aa  62  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0726214  normal  0.0482802 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  37.93 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0738  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 508 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1992  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 460 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.47 
 
 		 229 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4273  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1017  two component transcriptional regulator  39.62 
 
 		 229 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957911  normal  0.735899 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4295  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2257  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.38 
 
 		 227 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2146  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.41399  hitchhiker  0.000968824 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3217  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  36.84 
 
 		 501 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0283  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.21 
 
 		 456 aa  61.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0182  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.59 
 
 		 248 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.745426 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.62 
 
 		 318 aa  61.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3844  response regulator receiver domain-containing protein  42.99 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  34.45 
 
 		 971 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2015  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.65 
 
 		 228 aa  61.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1847  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 459 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.122843  normal  0.436579 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1617  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.53 
 
 		 860 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  32.71 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3907  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0268  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.21 
 
 		 456 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540037 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2716  response regulator  30.77 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4374  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.45297 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1047  DNA-binding transcriptional regulator TorR  33.94 
 
 		 236 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.499715  normal  0.229032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1112  DNA-binding transcriptional regulator TorR  33.94 
 
 		 236 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1051  DNA-binding transcriptional regulator TorR  33.94 
 
 		 236 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.44318 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  35.83 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  31.48 
 
 		 981 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1597  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.35 
 
 		 860 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.711633  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0237  response regulator receiver  40.59 
 
 		 248 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1873  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 437 aa  60.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.48 
 
 		 941 aa  60.5  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.9 
 
 		 221 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 		 248 aa  60.5  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0674  two-component response regulator CbrB  38.68 
 
 		 453 aa  60.5  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0916838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  39.81 
 
 		 236 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 		 1262 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>