15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3604 on replicon NC_009471
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009471  Acry_3604    100 
 
 
159 bp  315  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.96938  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3613  transposase, mutator type  89.68 
 
 
1128 bp  147  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.230884  normal  0.701856 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3615  transposase, mutator type  89.68 
 
 
1224 bp  147  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3247  transposase, mutator type  89.34 
 
 
1224 bp  139  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.203349  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3387  transposase, mutator type  92.31 
 
 
1224 bp  125  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3212  transposase, mutator type  91.3 
 
 
1224 bp  119  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0287  transposase, mutator type  90.22 
 
 
1224 bp  111  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.286188  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0776  transposase, mutator type  90.7 
 
 
1224 bp  107  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0805  transposase, mutator type  90.7 
 
 
1224 bp  107  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0098  transposase  85.83 
 
 
423 bp  101  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0110  transposase, mutator type  84 
 
 
1224 bp  71.9  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1379  transposase, mutator type  84 
 
 
1101 bp  71.9  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1691    84 
 
 
1225 bp  71.9  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0391354  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3015  transposase, mutator type  84 
 
 
1224 bp  71.9  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2796  transposase, mutator type  83.84 
 
 
1101 bp  69.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.520079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>