28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3413 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009468  Acry_3413  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  157  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1559  protein of unknown function DUF302  52 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874349  normal  0.0163758 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4759  hypothetical protein  48.72 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal  0.706872 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4906  hypothetical protein  48.72 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0532643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4909  domain of unknown function superfamily  48.72 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4859  hypothetical protein  48.72 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.103571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4835  hypothetical protein  48.72 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.770482  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0349  periplasmic protein  37.04 
 
 
168 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.112084  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1823  hypothetical protein  43.84 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2874  hypothetical protein  41.56 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1665  hypothetical protein  36.25 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8650  protein of unknown function DUF302  40 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997368  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0543  protein of unknown function DUF302  51.06 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4835  hypothetical protein  35.38 
 
 
197 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0007  protein of unknown function DUF302  46.88 
 
 
135 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.120765 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001057  putative inner membrane or exported protein  47.92 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3562  hypothetical protein  36.36 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2075  hypothetical protein  44.83 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0949  hypothetical protein  33.8 
 
 
150 aa  47  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.811465  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0376  protein of unknown function DUF302  36.36 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1380  protein of unknown function DUF302  39.39 
 
 
179 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1896  hypothetical protein  35 
 
 
135 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1260  hypothetical protein  36.84 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2556  hypothetical protein  34.15 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.299096  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1673  hypothetical protein  36.96 
 
 
172 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00536019  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1779  hypothetical protein  37.5 
 
 
151 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2704  hypothetical protein  39.34 
 
 
132 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556991  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05960  hypothetical protein  30.3 
 
 
306 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0678707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>