More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3346 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009468  Acry_3346  ABC transporter related  100 
 
 
285 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  47.04 
 
 
540 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  52.4 
 
 
534 aa  218  7e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  50.87 
 
 
534 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  49.13 
 
 
534 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.32 
 
 
548 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  49.13 
 
 
544 aa  208  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  48.73 
 
 
538 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  46.67 
 
 
538 aa  208  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  48.05 
 
 
558 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  48 
 
 
553 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  46.84 
 
 
547 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  49.15 
 
 
557 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  45.45 
 
 
585 aa  202  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4330  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 
540 aa  201  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  44.53 
 
 
545 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  43.85 
 
 
546 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  47.44 
 
 
550 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  47.6 
 
 
539 aa  198  7.999999999999999e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  44.86 
 
 
540 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  47.01 
 
 
552 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  48.72 
 
 
560 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  44.44 
 
 
557 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  44.4 
 
 
545 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  42.69 
 
 
550 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  45.02 
 
 
549 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  41.47 
 
 
552 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  44.35 
 
 
541 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  40.93 
 
 
549 aa  178  9e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  43.93 
 
 
554 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  44.83 
 
 
552 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  42.55 
 
 
532 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  43.97 
 
 
552 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3487  ABC transporter related  43.53 
 
 
552 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3270  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.11 
 
 
347 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4791  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.17 
 
 
317 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28753  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  40 
 
 
542 aa  168  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2704  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.76 
 
 
347 aa  168  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.298675 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4687  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.74 
 
 
317 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  43.53 
 
 
552 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.13 
 
 
360 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384991  normal  0.757279 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1164  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.89 
 
 
329 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1340  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  41.13 
 
 
342 aa  166  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.801873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4864  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.06 
 
 
316 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0210  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.08 
 
 
380 aa  165  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.323945  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  38.21 
 
 
575 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  39.83 
 
 
546 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  41.18 
 
 
326 aa  163  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1838  ABC transporter related  38.76 
 
 
556 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0573  ABC transporter related  44.09 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  36.59 
 
 
571 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3803  ABC transporter related  42.26 
 
 
556 aa  163  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3302  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.13 
 
 
326 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.08 
 
 
321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0419  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.63 
 
 
355 aa  162  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1064  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.66 
 
 
343 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0258  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.1 
 
 
336 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4353  ABC transporter related  39.92 
 
 
276 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.762556  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  39.75 
 
 
573 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0727  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 
308 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0404  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 
317 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0347  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 
317 aa  160  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.712529  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0065  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.38 
 
 
444 aa  160  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0310035 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2964  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.73 
 
 
364 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603569 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0788  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 
308 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0634106  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1371  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.66 
 
 
338 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.116668  normal  0.025409 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0906  putative ATP-binding component of dipeptide transport system  37.65 
 
 
330 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0105903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0626  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  43.18 
 
 
308 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2299  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.63 
 
 
391 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000220082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0570  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 
308 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0569  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 
308 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0659  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  43.18 
 
 
308 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.575275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0716  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 
308 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000233806 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4337  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  37.55 
 
 
332 aa  158  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.640243  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0981  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  39.85 
 
 
328 aa  158  9e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0870  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  37.11 
 
 
322 aa  158  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.772702  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3544  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.61 
 
 
328 aa  158  9e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0728  hypothetical protein  35.63 
 
 
603 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0747  hypothetical protein  36.44 
 
 
602 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  40.25 
 
 
593 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0554  ABC transporter-related protein  42.27 
 
 
308 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0218  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.86 
 
 
905 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0707728  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2062  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.92 
 
 
346 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0137889 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2962  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.48 
 
 
342 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04940  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.3 
 
 
326 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00804417  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  40.55 
 
 
629 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5658  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.27 
 
 
314 aa  156  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.521536 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4370  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.17 
 
 
338 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.737852  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0818  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.62 
 
 
362 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0202  hypothetical protein  37.9 
 
 
332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2487  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.39 
 
 
465 aa  155  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282444  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1215  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  41.6 
 
 
362 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.156942 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0889  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.07 
 
 
338 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0211  hypothetical protein  37.9 
 
 
332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12500  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  38 
 
 
354 aa  155  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.96533  normal  0.120346 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5293  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.26 
 
 
294 aa  155  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0867  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.45 
 
 
338 aa  155  7e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5508  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  35.12 
 
 
355 aa  155  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467167  normal  0.444532 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2765  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.68 
 
 
339 aa  155  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633226  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0668  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.29 
 
 
315 aa  155  9e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.758275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>