More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3327 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009468  Acry_3327  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 312 aa  619  1e-176  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0117566  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1089  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.51 
 
 		 350 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267927  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2904  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.82 
 
 		 347 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215191  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1213  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.18 
 
 		 346 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0133  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.53 
 
 		 350 aa  362  3e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526371  normal  0.412568 
 
 
-
 
NC_004310  BR1702  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.86 
 
 		 346 aa  362  6e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1645  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.86 
 
 		 346 aa  362  6e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0473  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.09 
 
 		 343 aa  362  6e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0886015  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2637  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.86 
 
 		 346 aa  361  7.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.21 
 
 		 337 aa  360  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3069  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.07 
 
 		 343 aa  359  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672447  normal  0.509611 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 		 342 aa  359  3e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0559678  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  57.57 
 
 		 355 aa  359  4e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.54 
 
 		 352 aa  358  8e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.302913  normal  0.384387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6906  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.54 
 
 		 348 aa  357  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3609  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.33 
 
 		 347 aa  357  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0333  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.34 
 
 		 338 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.693851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.21 
 
 		 358 aa  355  3.9999999999999996e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.74 
 
 		 345 aa  355  3.9999999999999996e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.31 
 
 		 340 aa  355  5.999999999999999e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.22 
 
 		 334 aa  355  6.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.89 
 
 		 334 aa  353  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.91 
 
 		 334 aa  354  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.22 
 
 		 336 aa  354  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 		 338 aa  353  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.79 
 
 		 338 aa  353  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.38 
 
 		 343 aa  352  2.9999999999999997e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.22 
 
 		 353 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 		 334 aa  352  4e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 		 341 aa  352  4e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.12 
 
 		 345 aa  352  4e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.24 
 
 		 345 aa  352  5e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3221  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.88 
 
 		 346 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3516  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.88 
 
 		 346 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.38 
 
 		 343 aa  352  5e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4803  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.02 
 
 		 349 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2138  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.03 
 
 		 342 aa  350  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.69 
 
 		 356 aa  350  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0751  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.42 
 
 		 351 aa  350  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.753333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1217  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.55 
 
 		 348 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.24 
 
 		 334 aa  350  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.55 
 
 		 348 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4269  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.03 
 
 		 348 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1452  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.89 
 
 		 325 aa  350  2e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467826  normal  0.361815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4436  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.42 
 
 		 344 aa  350  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.7 
 
 		 337 aa  350  2e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.89 
 
 		 348 aa  350  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 		 334 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 		 334 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.33 
 
 		 337 aa  350  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.57 
 
 		 334 aa  349  3e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4201  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.88 
 
 		 348 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.564106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0719  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.25 
 
 		 334 aa  349  3e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.20782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.57 
 
 		 338 aa  349  3e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.31 
 
 		 353 aa  349  4e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.7 
 
 		 344 aa  349  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.22 
 
 		 353 aa  348  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 		 334 aa  349  4e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.21 
 
 		 352 aa  348  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.82 
 
 		 336 aa  348  5e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.57 
 
 		 336 aa  348  5e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.25 
 
 		 335 aa  348  6e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0731  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.57 
 
 		 348 aa  348  6e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.33 
 
 		 337 aa  348  7e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5235  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.24 
 
 		 356 aa  348  7e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500344  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5310  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.57 
 
 		 388 aa  348  7e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4768  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.24 
 
 		 356 aa  348  7e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.38 
 
 		 334 aa  348  8e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.38 
 
 		 334 aa  348  8e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0693  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.53 
 
 		 341 aa  347  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.418287  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.38 
 
 		 334 aa  347  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.49 
 
 		 336 aa  347  1e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.88 
 
 		 363 aa  347  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.72 
 
 		 344 aa  347  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.25 
 
 		 334 aa  347  1e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.38 
 
 		 334 aa  347  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.88 
 
 		 335 aa  348  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.57 
 
 		 334 aa  347  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1205  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.39 
 
 		 334 aa  347  2e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0781696  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.88 
 
 		 352 aa  346  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 		 350 aa  347  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.57 
 
 		 334 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.24 
 
 		 334 aa  346  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.57 
 
 		 336 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3787  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.57 
 
 		 359 aa  346  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1104  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.57 
 
 		 348 aa  346  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.911797  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.57 
 
 		 338 aa  346  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.57 
 
 		 336 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.88 
 
 		 352 aa  345  4e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  56.91 
 
 		 336 aa  345  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.91 
 
 		 336 aa  345  5e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.91 
 
 		 336 aa  345  5e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1292  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.89 
 
 		 349 aa  345  5e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0531  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.89 
 
 		 348 aa  345  5e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.91 
 
 		 336 aa  345  5e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.91 
 
 		 336 aa  345  5e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.91 
 
 		 336 aa  345  5e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.24 
 
 		 338 aa  345  5e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  56.91 
 
 		 336 aa  345  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 337 aa  345  6e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>