More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3326 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009468  Acry_3326  DNA recombination protein RuvA  100 
 
 
206 aa  408  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0154506  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0112  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.61 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.04 
 
 
205 aa  105  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.060055  normal  0.258281 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0994  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.97 
 
 
197 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.199668  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.65 
 
 
197 aa  102  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2905  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.48 
 
 
204 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.366229  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.43 
 
 
199 aa  99.4  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2638  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.41 
 
 
205 aa  98.6  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.27 
 
 
199 aa  97.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.89 
 
 
189 aa  97.1  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.250827  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3515  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.67 
 
 
204 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4169  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.3 
 
 
205 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337452  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.14 
 
 
199 aa  95.9  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3067  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.66 
 
 
205 aa  96.3  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32025  normal  0.444921 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0850  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.43 
 
 
205 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1217  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.42 
 
 
200 aa  95.5  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.713526 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0993  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.55 
 
 
197 aa  95.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257053  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1290  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.3 
 
 
205 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.14 
 
 
199 aa  95.1  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4271  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.3 
 
 
205 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.580412  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3220  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.24 
 
 
204 aa  94.4  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.573398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4805  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.81 
 
 
205 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521325  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
200 aa  94  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1088  DNA recombination protein RuvA  38.62 
 
 
212 aa  94.4  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153708  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0952  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.18 
 
 
197 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1372  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.01 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3522  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.59 
 
 
206 aa  93.2  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1646  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.41 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1703  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.41 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.314833  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0111  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.01 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4502  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.55 
 
 
198 aa  92.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3605  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.12 
 
 
205 aa  92  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0422  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.97 
 
 
204 aa  92  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.199605  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.01 
 
 
208 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.232261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0928  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.01 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.157529  normal  0.130269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0964  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.01 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1010  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.17 
 
 
197 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.806868  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1212  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.96 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.41 
 
 
198 aa  90.5  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2725  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.43 
 
 
205 aa  89.4  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2140  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.32 
 
 
199 aa  89.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.497203  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1013  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.67 
 
 
197 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.72 
 
 
187 aa  89  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
194 aa  88.6  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0003  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.69 
 
 
209 aa  88.6  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.28 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.28 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1446  hypothetical protein  37.5 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.23 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2323  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.07 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.658563  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.66 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1061  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.96 
 
 
194 aa  86.3  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0061  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
193 aa  85.9  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0062  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
193 aa  85.9  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23532  normal  0.677868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.18 
 
 
205 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6908  Holliday junction DNA helicase RuvA  35 
 
 
205 aa  85.5  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.282799 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.52 
 
 
190 aa  85.5  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3126  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
197 aa  85.5  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.735644  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6947  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.52 
 
 
195 aa  85.1  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01215  Holliday junction DNA helicase motor protein  36.43 
 
 
193 aa  85.5  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
205 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
205 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1414  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.9 
 
 
199 aa  84.7  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000662939  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1432  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  29.67 
 
 
199 aa  84.7  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000016322  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0988  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
202 aa  84.7  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
200 aa  84  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0785  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.88 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.247616  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0005  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.4 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000354643  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1104  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.88 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.451698  normal  0.544618 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.46 
 
 
193 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3204  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.76 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0310  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.1 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.966825  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01557  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.5 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214116  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.2 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0320  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.59 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.219542  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0335  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.52 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.642504  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.2 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.75 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0942  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.74 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.2 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  36.11 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.2 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.86 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.96 
 
 
203 aa  82  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.07 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1268  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.25 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.20539  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1363  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.64 
 
 
202 aa  81.3  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245044  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12320  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.34 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0731595  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0269  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.64 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0894  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.76 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00161936  normal  0.093504 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0150  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.1 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  34.07 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4665  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.21 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3178  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.29 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0028  Holliday junction DNA helicase  29.19 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.591728 
 
 
-
 
NC_002950  PG0811  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.29 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  38.05 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1369  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.69 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0441824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4240  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.59 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.215143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>