12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3294 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009468  Acry_3294    100 
 
 		 717 bp  1421    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0805092  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  100 
 
 		 1569 bp  135  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  84.88 
 
 		 759 bp  67.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  87.34 
 
 		 762 bp  61.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  80.92 
 
 		 765 bp  61.9  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  82.35 
 
 		 744 bp  60  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  88.68 
 
 		 762 bp  58  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  81.9 
 
 		 774 bp  58  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  88.68 
 
 		 762 bp  58  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  89.36 
 
 		 762 bp  54  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  93.94 
 
 		 783 bp  50.1  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  88.64 
 
 		 762 bp  48.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>