230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3162 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009467  Acry_3162  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 
145 aa  280  6.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.716261  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3123  Na+/H+ antiporter NhaA  95.17 
 
 
449 aa  268  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158144  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3215  Na+/H+ antiporter NhaA  99.28 
 
 
456 aa  265  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0144  Na+/H+ antiporter NhaA  58.09 
 
 
446 aa  160  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174095  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51740  Na+/H+ antiporter NhaA  53.28 
 
 
446 aa  142  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.9845  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2989  Na+/H+ antiporter NhaA  54.55 
 
 
460 aa  128  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  48.89 
 
 
468 aa  122  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  52.78 
 
 
423 aa  117  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  48.51 
 
 
402 aa  116  7.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.72 
 
 
388 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.72 
 
 
388 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.72 
 
 
388 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.72 
 
 
388 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.72 
 
 
388 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1928  Na+/H+ antiporter NhaA  51.13 
 
 
376 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.93 
 
 
388 aa  114  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.93 
 
 
388 aa  114  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  51.88 
 
 
452 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.93 
 
 
388 aa  114  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.93 
 
 
388 aa  114  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.93 
 
 
388 aa  114  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.93 
 
 
388 aa  114  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  45.93 
 
 
388 aa  114  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.93 
 
 
388 aa  114  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  49.25 
 
 
453 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  45.86 
 
 
438 aa  114  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  46.67 
 
 
472 aa  113  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  49.62 
 
 
455 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  49.28 
 
 
450 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  45.93 
 
 
388 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  48.87 
 
 
453 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  44.9 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1563  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.47 
 
 
421 aa  113  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.172648  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.04 
 
 
390 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  45.21 
 
 
436 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  45.21 
 
 
451 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  44.78 
 
 
396 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0371  Na+/H+ antiporter NhaA  45.45 
 
 
452 aa  110  9e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.92 
 
 
397 aa  109  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4502  Na+/H+ antiporter NhaA  48.92 
 
 
400 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  47.76 
 
 
392 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  47.06 
 
 
455 aa  108  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  46.56 
 
 
401 aa  108  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.51 
 
 
392 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.88 
 
 
391 aa  107  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.38 
 
 
395 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.43 
 
 
399 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  49.24 
 
 
455 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.97 
 
 
398 aa  104  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3487  Na+/H+ antiporter NhaA  47.01 
 
 
395 aa  104  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.16157 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  42.54 
 
 
425 aa  103  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.96 
 
 
394 aa  103  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.96 
 
 
394 aa  103  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2962  Na+/H+ antiporter NhaA  47.58 
 
 
481 aa  103  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.48 
 
 
394 aa  103  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.85 
 
 
382 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.98 
 
 
394 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.43 
 
 
382 aa  102  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.51 
 
 
391 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  39.44 
 
 
383 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.73 
 
 
391 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5174  sodium-proton antiporter NhaA  47.01 
 
 
391 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  45.93 
 
 
876 aa  101  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2123  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.25 
 
 
400 aa  101  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  48.48 
 
 
451 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.43 
 
 
399 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  37.86 
 
 
395 aa  100  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07000  Na+/H+ antiporter NhaA  41.43 
 
 
514 aa  101  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107154  normal  0.0342501 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1838  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.55 
 
 
400 aa  100  9e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0364  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.52 
 
 
391 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  44.68 
 
 
444 aa  99.8  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  42.52 
 
 
629 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  42.96 
 
 
398 aa  99.8  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0600  Na+/H+ antiporter NhaA  44.93 
 
 
424 aa  99.4  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171137  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3610  Na+/H+ antiporter NhaA  43.84 
 
 
413 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150292  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.7 
 
 
391 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  41.96 
 
 
391 aa  99.8  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.98 
 
 
397 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.98 
 
 
397 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  42.96 
 
 
424 aa  99  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  46.27 
 
 
444 aa  98.6  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3287  Na+/H+ antiporter NhaA  45.52 
 
 
413 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  40.29 
 
 
406 aa  98.6  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.85 
 
 
389 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1646  Na+/H+ antiporter NhaA  40.8 
 
 
382 aa  98.6  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.98 
 
 
389 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  40.8 
 
 
382 aa  97.8  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0688  Na+/H+ antiporter NhaA  40.85 
 
 
389 aa  97.8  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2016  Na+/H+ antiporter NhaA  40.8 
 
 
382 aa  98.2  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2568  Na+/H+ antiporter NhaA  50 
 
 
424 aa  97.8  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.98 
 
 
389 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  44.53 
 
 
393 aa  97.4  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.85 
 
 
389 aa  97.4  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.98 
 
 
389 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.98 
 
 
389 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2456  Na+/H+ antiporter  46.67 
 
 
438 aa  96.7  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00270708  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  47.41 
 
 
475 aa  96.7  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.14 
 
 
391 aa  96.7  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.85 
 
 
389 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  39.55 
 
 
386 aa  96.7  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>