129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3131 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009467  Acry_3131  hypothetical protein  100 
 
 
60 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.753056  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3536  ubiquinol oxidase, subunit II  57.5 
 
 
269 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1858  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase subunit II  52.63 
 
 
330 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.2499 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3073  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  58.33 
 
 
317 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0267  ubiquinol oxidase, subunit II  53.85 
 
 
304 aa  54.7  0.0000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0165424  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0048  ubiquinol oxidase, subunit II  61.11 
 
 
335 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184158  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0954  ubiquinol oxidase, subunit II  52.63 
 
 
302 aa  54.3  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0042  ubiquinol oxidase, subunit II  61.11 
 
 
341 aa  53.9  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1295  ubiquinol oxidase, subunit II  55.26 
 
 
295 aa  53.9  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000833627  hitchhiker  0.00150484 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47210  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  55.26 
 
 
331 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000853268  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0042  ubiquinol oxidase, subunit II  61.11 
 
 
341 aa  53.9  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1001  cytochrome c oxidase polypeptide II  56.1 
 
 
310 aa  53.9  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0899  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  56.1 
 
 
298 aa  53.9  0.0000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3968  ubiquinol oxidase, subunit II  55.26 
 
 
300 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44494  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0812  ubiquinol oxidase subunit 2  52.63 
 
 
313 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.642349 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0479  ubiquinol oxidase, subunit II  55.26 
 
 
295 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5793  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  55.26 
 
 
319 aa  52.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0258171  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0835  ubiquinol oxidase, subunit II  52.63 
 
 
313 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4073  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  55.26 
 
 
326 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581224  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0849  ubiquinol oxidase, subunit II  52.63 
 
 
313 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3269  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  52.78 
 
 
320 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.854016  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4579  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit II  52.63 
 
 
306 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1043  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  50 
 
 
320 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0760278  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3649  ubiquinol oxidase, subunit II  52.63 
 
 
299 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00009  ubiquinol oxidase, subunit II  46.34 
 
 
311 aa  52.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.829439  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1788  ubiquinol oxidase, subunit II  55.26 
 
 
377 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0548313  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2882  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  55.56 
 
 
317 aa  51.6  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5376  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  52.63 
 
 
283 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1090  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  47.37 
 
 
316 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000286734  hitchhiker  0.00000462839 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2814  ubiquinol oxidase, subunit II  63.64 
 
 
340 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5824  ubiquinol oxidase, subunit II  52.63 
 
 
305 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5009  ubiquinol oxidase, subunit II  52.63 
 
 
299 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348819  normal  0.0229485 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3163  ubiquinol oxidase, subunit II  63.64 
 
 
320 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000193741 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2917  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase subunit II  55.56 
 
 
329 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.215988  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4648  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  57.14 
 
 
313 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.117472  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1637  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  52.63 
 
 
297 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140878  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0948  ubiquinol oxidase, subunit II  52.78 
 
 
322 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0089  ubiquinol oxidase, subunit II  50 
 
 
348 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1209  ubiquinol oxidase, subunit II  52.63 
 
 
295 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0864701  normal  0.353676 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1977  ubiquinol oxidase, subunit II  52.63 
 
 
283 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0982  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  52.78 
 
 
323 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.317377  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0993  ubiquinol oxidase, subunit II  52.63 
 
 
300 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2107  ubiquinol oxidase, subunit II  52.63 
 
 
295 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295579  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2714  ubiquinol oxidase, subunit II  52.63 
 
 
296 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.218735  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0224  ubiquinol oxidase, subunit II  52.78 
 
 
346 aa  50.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2716  ubiquinol oxidase, subunit II  52.63 
 
 
330 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2090  ubiquinol oxidase, subunit II  52.63 
 
 
281 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158358  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1140  ubiquinol oxidase, subunit II  47.37 
 
 
351 aa  50.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1325  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  51.52 
 
 
313 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0603  ubiquinol oxidase, subunit II  52.63 
 
 
296 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0194  ubiquinol oxidase, subunit II  52.63 
 
 
300 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2833  ubiquinol oxidase polypeptide II precursor  52.63 
 
 
296 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6006  ubiquinol oxidase, subunit II  52.63 
 
 
295 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2071  ubiquinol oxidase, subunit II  52.63 
 
 
295 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.741779  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1369  ubiquinol oxidase, subunit II  52.63 
 
 
300 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2410  ubiquinol oxidase, subunit II  52.63 
 
 
282 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1566  ubiquinol oxidase, subunit II  52.63 
 
 
295 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2880  ubiquinol oxidase, subunit II  52.63 
 
 
282 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2772  ubiquinol oxidase, subunit II  52.63 
 
 
296 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2572  ubiquinol oxidase, subunit II  52.63 
 
 
330 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0225  ubiquinol oxidase, subunit II  52.63 
 
 
295 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1722  ubiquinol oxidase, subunit II  52.63 
 
 
282 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243968  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0366  ubiquinol oxidase, subunit II  50 
 
 
316 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4376  ubiquinol oxidase, subunit II  54.29 
 
 
314 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.918748  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5735  ubiquinol oxidase, subunit II  55.32 
 
 
426 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010556 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0595  ubiquinol oxidase, subunit II  55.32 
 
 
385 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4854  ubiquinol oxidase, subunit II  48.94 
 
 
387 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2284  ubiquinol oxidase, subunit II  46.81 
 
 
363 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4031  ubiquinol oxidase, subunit II  47.37 
 
 
342 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1744  putative cytochrome o ubiquinol oxidase chain II protein  51.06 
 
 
343 aa  49.7  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195887  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3858  ubiquinol oxidase, subunit II  50 
 
 
347 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2030  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  57.78 
 
 
390 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463087  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4778  ubiquinol oxidase, subunit II  53.06 
 
 
385 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4350  ubiquinol oxidase, subunit II  50 
 
 
351 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0294  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  55 
 
 
272 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1141  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  51.52 
 
 
313 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.408263 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3823  ubiquinol oxidase, subunit II  47.37 
 
 
342 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0349218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3914  ubiquinol oxidase, subunit II  47.37 
 
 
342 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4146  ubiquinol oxidase, subunit II  50 
 
 
367 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4706  ubiquinol oxidase, subunit II  46.81 
 
 
387 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4218  ubiquinol oxidase, subunit II  50 
 
 
361 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4337  ubiquinol oxidase, subunit II  46.81 
 
 
387 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195631  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1731  ubiquinol oxidase, subunit II  46.81 
 
 
409 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1508  ubiquinol oxidase, subunit II  48.94 
 
 
409 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.205706  normal  0.237514 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4046  ubiquinol oxidase, subunit II  51.06 
 
 
342 aa  48.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25718  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0242  ubiquinol oxidase, subunit II  55.32 
 
 
385 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5108  ubiquinol oxidase, subunit II  46.94 
 
 
400 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03912  Ubiquinol oxidase polypeptide II (Cytochrome o subunit 2) (Oxidase BO(3) subunit 2) (Cytochrome o ubiquinol oxidase subunit  50 
 
 
313 aa  47.8  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0433  ubiquinol oxidase, subunit II  50 
 
 
306 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.984358  normal  0.776593 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05491  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  50 
 
 
273 aa  47.4  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2265  ubiquinol oxidase, subunit II  42.86 
 
 
349 aa  47  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.384743  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2775  ubiquinol oxidase, subunit II  42.86 
 
 
349 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.608558 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0545  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  37.5 
 
 
309 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00734942  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1290  ubiquinol oxidase, subunit II  40 
 
 
308 aa  46.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001553  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit II  47.22 
 
 
256 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.708741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4057  ubiquinol oxidase, subunit II  44.68 
 
 
348 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.202899  normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0482  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  37.5 
 
 
309 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000191941  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3177  ubiquinol oxidase, subunit II  37.5 
 
 
315 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000302564  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0490  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  37.5 
 
 
318 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000373186  hitchhiker  0.00204632 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0484  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  37.5 
 
 
318 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000643315  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>