More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2664 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2664  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  100 
 
 
231 aa  462  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.112517  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0184  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  65.2 
 
 
233 aa  298  4e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.426219  normal  0.189084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3120  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  60.78 
 
 
232 aa  282  3.0000000000000004e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1181  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  61.33 
 
 
231 aa  269  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1587  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  59.11 
 
 
233 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0863769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0574  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  60.79 
 
 
226 aa  265  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.797149  normal  0.0258582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0599  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  60.35 
 
 
226 aa  264  8e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0215465  normal  0.0248858 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0610  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  60.35 
 
 
226 aa  262  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.108966 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1635  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  59.47 
 
 
233 aa  261  8.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5406  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  57.08 
 
 
233 aa  259  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306365  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1749  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  57.33 
 
 
233 aa  258  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4360  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  59.03 
 
 
226 aa  257  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.553725  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0421  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  59.11 
 
 
228 aa  257  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0357294  hitchhiker  0.0065391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1674  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  58.22 
 
 
228 aa  255  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.986245  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1306  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  57.71 
 
 
233 aa  255  4e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4344  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  56.89 
 
 
233 aa  254  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.083383  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1279  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  55.84 
 
 
222 aa  254  9e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4091  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  55.17 
 
 
232 aa  253  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174193  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3716  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  56.44 
 
 
233 aa  252  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106369  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0709  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  58.67 
 
 
230 aa  250  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0353041  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1032  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  56.05 
 
 
225 aa  249  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0591  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  56.25 
 
 
221 aa  246  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.970256 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1030  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  55.11 
 
 
220 aa  246  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.176971 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1500  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  53.81 
 
 
223 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203071  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3198  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  52.23 
 
 
230 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0425  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  54.67 
 
 
221 aa  244  9e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0473378  normal  0.53438 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2250  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  52.23 
 
 
227 aa  244  9e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296271 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1079  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  55.11 
 
 
223 aa  243  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1902  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  52.02 
 
 
224 aa  241  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2587  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  54.02 
 
 
222 aa  241  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.446689  normal  0.175392 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2384  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  54.05 
 
 
223 aa  239  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0336297  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0840  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  54.05 
 
 
223 aa  238  5e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0832  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  54.05 
 
 
223 aa  238  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1929  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50.67 
 
 
223 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2482  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2306  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  51.79 
 
 
235 aa  236  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000119271  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0861  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  48.88 
 
 
222 aa  236  2e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.392911  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1463  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  51.75 
 
 
222 aa  235  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.146312  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4176  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  51.33 
 
 
227 aa  235  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4136  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  51.33 
 
 
227 aa  235  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1955  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit I  50 
 
 
231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00799844 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2138  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50.67 
 
 
223 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372851  normal  0.0996971 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2962  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  53.78 
 
 
222 aa  232  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305292  normal  0.318263 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50 
 
 
233 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3506  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  49.78 
 
 
224 aa  230  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.832851  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1011  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  49.77 
 
 
233 aa  228  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3449  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  52.42 
 
 
220 aa  229  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0407  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  51.34 
 
 
224 aa  227  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0819  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  51.34 
 
 
221 aa  223  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0065  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  53.1 
 
 
222 aa  223  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.393472  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5057  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  53.88 
 
 
231 aa  222  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1523  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  47.32 
 
 
235 aa  222  4e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2049  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  49.55 
 
 
236 aa  222  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.81616  normal  0.103111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6348  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  46.43 
 
 
228 aa  221  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2128  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  55.11 
 
 
222 aa  221  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0275775  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0803  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  55.11 
 
 
222 aa  221  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37990  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit I  53.49 
 
 
229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0822078  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0800  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  48.66 
 
 
217 aa  219  3e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1473  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  49.09 
 
 
234 aa  219  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  53.78 
 
 
222 aa  218  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0937  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  48.66 
 
 
234 aa  217  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0322  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  47.32 
 
 
227 aa  216  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0280  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  47.32 
 
 
227 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0265  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  47.32 
 
 
227 aa  216  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0268  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  47.32 
 
 
227 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0293  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  47.32 
 
 
227 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4981  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  46.88 
 
 
227 aa  216  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  47.32 
 
 
227 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0325  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  47.32 
 
 
227 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3954  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  53.3 
 
 
218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256378 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0762  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  51.11 
 
 
231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0163287  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0396  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  51.33 
 
 
226 aa  214  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977913  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0274  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  46.88 
 
 
227 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3982  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  52 
 
 
218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3904  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  52 
 
 
218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1055  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50.67 
 
 
228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.263226 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  46.43 
 
 
227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1625  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  45.54 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.93028  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2543  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  51.14 
 
 
222 aa  211  7e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26697  normal  0.304828 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6877  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  52.44 
 
 
223 aa  211  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2235  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  46.43 
 
 
231 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3841  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  51.11 
 
 
218 aa  209  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0461  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  46.88 
 
 
231 aa  209  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1734  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  45.54 
 
 
226 aa  209  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000303674  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1620  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  47.32 
 
 
226 aa  208  4e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.618821  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17251  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  48.21 
 
 
217 aa  208  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2755  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  46.88 
 
 
232 aa  208  6e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000714476  hitchhiker  0.00646528 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1853  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  46.88 
 
 
216 aa  208  7e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0272  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  45.54 
 
 
227 aa  207  8e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3613  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  51.16 
 
 
225 aa  207  9e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1655  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  44.64 
 
 
233 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.549373  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2296  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  49.78 
 
 
230 aa  206  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294122  normal  0.0182898 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1325  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  46.61 
 
 
231 aa  206  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4766  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50.22 
 
 
223 aa  205  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304119  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5128  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  51.16 
 
 
224 aa  205  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3841  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50.85 
 
 
239 aa  205  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0161159  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4332  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  49.78 
 
 
222 aa  204  7e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1450  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  43.56 
 
 
232 aa  204  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0520  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  45.09 
 
 
224 aa  204  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0537436  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0187  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  45.54 
 
 
217 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1134  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  48.21 
 
 
228 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>