274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2499 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2499  amino acid permease-associated region  100 
 
 
489 aa  937    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0687107  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1121  amino acid permease-associated region  36.83 
 
 
490 aa  306  5.0000000000000004e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0304101  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0738  amino-acid permease RocC  22.55 
 
 
468 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0773  amino acid permease  22.55 
 
 
471 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000509453  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4599  amino-acid permease RocC  22.55 
 
 
471 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000205089  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  24.45 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0592  amino acid permease-associated region  22.13 
 
 
472 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 
441 aa  64.3  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  25.75 
 
 
460 aa  62.4  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  25.45 
 
 
458 aa  60.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0831  amino-acid permease RocC  24.24 
 
 
297 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  27.6 
 
 
447 aa  60.5  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  26.19 
 
 
452 aa  60.1  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0448  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 
456 aa  60.1  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.807242  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3727  amino acid transporter  22.63 
 
 
468 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2036  amino acid permease-associated region  22.63 
 
 
468 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.790711  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  25.96 
 
 
463 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  23.7 
 
 
422 aa  58.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1458  amino acid permease-associated region  21.82 
 
 
461 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  21.66 
 
 
445 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0627  amino acid transporter  22.11 
 
 
458 aa  58.2  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1447  amino acid permease-associated region  24.31 
 
 
460 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302331  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3973  amino acid permease-associated region  28.19 
 
 
455 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  24.89 
 
 
476 aa  57  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  23.94 
 
 
455 aa  57  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2259  D-alanine/D-serine/glycine permease  22.26 
 
 
471 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.046598  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2045  D-alanine/D-serine/glycine permease  22.26 
 
 
471 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488299  normal  0.01176 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2361  D-alanine/D-serine/glycine permease  22.26 
 
 
474 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4759  D-alanine/D-serine/glycine permease  22.92 
 
 
467 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.329595  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4676  D-alanine/D-serine/glycine permease  22.92 
 
 
469 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00205284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4407  amino acid ABC transporter permease  24.82 
 
 
460 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0417319 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4794  D-alanine/D-serine/glycine permease  22.92 
 
 
467 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.489012  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  23.75 
 
 
467 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  23.75 
 
 
467 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4816  D-alanine/D-serine/glycine permease  22.92 
 
 
469 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.343115  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2179  amino acid permease-associated region  22.93 
 
 
468 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0711158  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 
462 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 
462 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4666  D-alanine/D-serine/glycine permease  22.92 
 
 
469 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0386097  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6094  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 
463 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679218  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  25.55 
 
 
465 aa  55.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 
462 aa  55.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1041  amino acid permease-associated region  27.69 
 
 
467 aa  55.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000184403  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 
462 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  26.08 
 
 
436 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  23.08 
 
 
467 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  23.75 
 
 
467 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  27.96 
 
 
463 aa  55.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  23.75 
 
 
467 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0992  hypothetical protein  26.65 
 
 
535 aa  54.7  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  32.37 
 
 
429 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4685  D-alanine/D-serine/glycine permease  22.92 
 
 
467 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000407821  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  26.01 
 
 
454 aa  54.3  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  22.1 
 
 
473 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  23.75 
 
 
467 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  25.59 
 
 
516 aa  54.3  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0378  D-alanine/D-serine/glycine permease  25.69 
 
 
469 aa  54.3  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000253333  normal  0.311262 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  22.64 
 
 
486 aa  53.9  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1683  amino acid transporter  23.54 
 
 
508 aa  53.9  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000204712  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4458  D-alanine/D-serine/glycine permease  22.5 
 
 
467 aa  53.5  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000362617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0129  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 
546 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  22.1 
 
 
473 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3470  S-methylmethionine transporter  24.37 
 
 
469 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04080  D-alanine/D-serine/glycine transporter  22.5 
 
 
470 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000357991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3785  amino acid permease-associated region  22.5 
 
 
470 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000255253  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3798  D-alanine/D-serine/glycine permease  22.5 
 
 
470 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000560112  normal  0.948087 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  22.81 
 
 
467 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0772  amino acid ABC transporter, permease protein  21.83 
 
 
475 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5725  D-alanine/D-serine/glycine permease  22.5 
 
 
470 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00067927  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0555  amino acid ABC transporter permease  21.83 
 
 
473 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000183711  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 
773 aa  52.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  24.78 
 
 
463 aa  53.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1825  D-alanine/D-serine/glycine permease  23.43 
 
 
466 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13282  cationic amino acid transport integral membrane protein  26.9 
 
 
495 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.260226 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04043  hypothetical protein  22.5 
 
 
470 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000255427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0700  amino acid ABC transporter, permease protein  21.83 
 
 
475 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2830  amino acid permease-associated region  24.49 
 
 
488 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.510786  normal  0.137623 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78721  amino acid permease  23.68 
 
 
597 aa  52.8  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00834318 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4776  D-alanine/D-serine/glycine permease  22.5 
 
 
470 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471149  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4749  D-alanine/D-serine/glycine permease  22.5 
 
 
470 aa  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000228678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0610  amino acid ABC transporter permease  21.83 
 
 
475 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0679  amino acid ABC transporter, permease protein  21.83 
 
 
475 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.711414  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0786  amino acid tranporter  25.13 
 
 
459 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal  0.194759 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0643  amino acid ABC transporter permease  21.83 
 
 
475 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2418  lysine transporter  23.61 
 
 
490 aa  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4659  amino acid ABC transporter, permease protein  21.83 
 
 
476 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350234  hitchhiker  4.63253e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  23.48 
 
 
467 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  23.48 
 
 
467 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0507  amino acid transporter  23.22 
 
 
524 aa  51.6  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.229334  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  28.86 
 
 
443 aa  51.6  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3706  hypothetical protein  26.15 
 
 
483 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.130124 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  24.42 
 
 
500 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  25.38 
 
 
447 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  24.15 
 
 
471 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  21.45 
 
 
476 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  25.27 
 
 
770 aa  51.2  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2325  amino acid permease-associated region  22.92 
 
 
476 aa  51.6  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000716314  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  21.93 
 
 
467 aa  51.2  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  22.31 
 
 
483 aa  50.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3459  amino acid permease-associated region  24.37 
 
 
459 aa  51.2  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>