58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2449 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2449  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  528  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0491792  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0360  protein of unknown function DUF1009  59.93 
 
 
282 aa  297  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10118  normal  0.0391564 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4427  hypothetical protein  48 
 
 
306 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0476773 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1598  hypothetical protein  47.57 
 
 
286 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.653331  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3183  hypothetical protein  50.18 
 
 
291 aa  203  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605999  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2792  hypothetical protein  44.2 
 
 
283 aa  189  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0568081 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2845  hypothetical protein  42.86 
 
 
285 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3256  protein of unknown function DUF1009  41.39 
 
 
285 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1847  hypothetical protein  41.82 
 
 
288 aa  176  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.730915  normal  0.19763 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3376  protein of unknown function DUF1009  39.85 
 
 
270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1142  hypothetical protein  42.51 
 
 
295 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0304239  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1852  hypothetical protein  38.01 
 
 
278 aa  168  9e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000781514  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1787  protein of unknown function DUF1009  42.46 
 
 
293 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.240236  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4505  hypothetical protein  40.66 
 
 
285 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1594  protein of unknown function DUF1009  42.11 
 
 
293 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.983213  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1706  hypothetical protein  40 
 
 
285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.349467  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2448  hypothetical protein  40.73 
 
 
284 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.448088 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2816  hypothetical protein  42.12 
 
 
285 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2040  hypothetical protein  41.03 
 
 
299 aa  162  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.229443  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1375  hypothetical protein  37.73 
 
 
288 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000871979  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2142  hypothetical protein  47.41 
 
 
273 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2512  hypothetical protein  40.27 
 
 
290 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101135  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1125  hypothetical protein  40.81 
 
 
271 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.33509  decreased coverage  0.00103642 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1108  hypothetical protein  39.86 
 
 
300 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0897  hypothetical protein  39.54 
 
 
278 aa  152  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0737012  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1150  hypothetical protein  39.49 
 
 
300 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1145  protein of unknown function DUF1009  39.18 
 
 
268 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1214  protein of unknown function DUF1009  39.18 
 
 
268 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1086  hypothetical protein  39.18 
 
 
268 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2226  protein of unknown function DUF1009  36.3 
 
 
278 aa  149  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.212193  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3908  hypothetical protein  42.38 
 
 
265 aa  149  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0741095  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1373  hypothetical protein  47.04 
 
 
273 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.848143  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3435  hypothetical protein  43.21 
 
 
287 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.853398  normal  0.369907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1392  hypothetical protein  42.22 
 
 
297 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3002  protein of unknown function DUF1009  37.14 
 
 
281 aa  142  6e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2715  hypothetical protein  47.04 
 
 
273 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0593  hypothetical protein  35.32 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0138266  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17540  hypothetical protein  32.49 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000813715  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1393  hypothetical protein  41.84 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78507  hitchhiker  0.00530667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1527  protein of unknown function DUF1009  43.06 
 
 
281 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254231  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2839  hypothetical protein  35.04 
 
 
273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2359  protein of unknown function DUF1009  33.45 
 
 
294 aa  132  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5219  protein of unknown function DUF1009  40.73 
 
 
282 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0644  hypothetical protein  42.81 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.650994  normal  0.611382 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2449  hypothetical protein  38.87 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  hitchhiker  0.00174485 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4554  hypothetical protein  32.06 
 
 
301 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.679907  normal  0.0581006 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  32.21 
 
 
649 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1403  hypothetical protein  38.26 
 
 
262 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.408064  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0371  protein of unknown function DUF1009  27.68 
 
 
267 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0143196  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5142  protein of unknown function DUF1009  41.52 
 
 
282 aa  123  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424077  normal  0.0362287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4677  hypothetical protein  41.16 
 
 
282 aa  122  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.299114  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1503  conserved hypothetical protein DUF1009  40.38 
 
 
265 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.217673  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2350  protein of unknown function DUF1009  29.52 
 
 
268 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.271285  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3873  hypothetical protein  35.66 
 
 
281 aa  118  9e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.429993  normal  0.0170553 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0079  hypothetical protein  28.41 
 
 
273 aa  115  8.999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000676342  hitchhiker  0.00000000000219127 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0884  protein of unknown function DUF1009  30.31 
 
 
287 aa  110  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1287  protein of unknown function DUF1009  30.71 
 
 
269 aa  105  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0767794  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1010  protein of unknown function DUF1009  26.59 
 
 
261 aa  89.4  6e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00304045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>