28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2200 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2200  OsmC family protein  100 
 
 
161 aa  323  5e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3747  OsmC family protein  47.97 
 
 
148 aa  142  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49110  redox protein  46.98 
 
 
153 aa  142  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1365  OsmC family protein  46.26 
 
 
147 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1205  OsmC family protein  46.26 
 
 
147 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.274132  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1144  OsmC family protein  45.58 
 
 
147 aa  140  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2833  OsmC family protein  44.6 
 
 
158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.829807  hitchhiker  0.00176763 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3777  OsmC family protein  43.84 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.358184  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2284  OsmC family protein  43.54 
 
 
147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0042  OsmC family protein  39.39 
 
 
162 aa  94.4  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4182  OsmC family protein  35.62 
 
 
155 aa  89  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1521  hypothetical protein  34.23 
 
 
155 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.483941  normal  0.516484 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  31.54 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14900  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  36.36 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136594  normal  0.328629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  45.45 
 
 
412 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1183  hypothetical protein  51.06 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  28.57 
 
 
144 aa  43.9  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  31.19 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  29.7 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  39.29 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  36.07 
 
 
406 aa  43.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  33.94 
 
 
134 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  39.29 
 
 
132 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  35.71 
 
 
405 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  27.27 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  27.4 
 
 
407 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  46.15 
 
 
170 aa  40.4  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  38.1 
 
 
132 aa  40.4  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>